Biofyzikální chemie a molekulární onkologie
Běžící projekty
Vývoj elektroanalytických metod interakcí galektinů a glykomimetických ligandů - Nových potenciálních protinádorových léčiv
Identifikační kód projektu: 23-06115S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2023 - 2025
Řešitel: Daňhel Aleš
Cíle projektu:
1. Syntéza nových organokovových ligandů galektinů využívající elektroaktivní areny ferrocenu a ruthenia.
2. Vývoj spektro-elektrochemických metod pro charakterizace ligandů a pro studium interakci galektinů s ligandy.
3. Výběr ligandů jako potenciálních inhibitorů galektinů.
Ukončené projekty
Elektroaktivní a fluorescentní modifikace nukleových kyselin pro studium struktury a interakcí a pro aplikace v diagnostice
Identifikační kód projektu: 22-11252S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2022 - 2024
Řešitel: Miroslav Fojta
Lokální struktury DNA a jejich role ve funkci mutantního proteinu p53 z lidských nádorů
Identifikační kód projektu: 22-21903S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2022 - 2024
Řešitel: Václav Brázda
Nové nástroje pro výzkum a diagnostiku glykanů a glykoproteinů s využitím elektrochemické analýzy a chemické modifikace
Identifikační kód projektu: 22-26590S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2022 - 2024
Řešitel: Veronika Ostatná
Vývoj citlivého a selektivního elektrochemického genosenzoru pro terénní detekci "citrus bark cracking" viroidu (CBCVBd)
Identifikační kód projektu: 21-46325L
Poskytovatel: GAČR
Spolupracovník: Samo Hocevar, National Institute of Chemistry, Ljubljana
Řešení projektu: 2021 - 2024
Účastnické země: Slovinsko
Řešitel: Miroslav Fojta
Studium elektrochemických a adsorpčních dějů na nanostrukturovaných sp2 a sp3 uhlíkových površích ve vztahu k jejich fyzikálně chemickým vlastnostem
Identifikační kód projektu: 20-03187S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2020 - 2022
Řešitel: Hana Pivoňková
Tuning of electrochemical properties of boron polyhedral by advanced substitutions towards their use in bioconjugates: systematic basic research
Identifikační kód projektu: 19-04630S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2019 - 2021
Řešitel: Lukáš Fojt
Guanine quadruplex-mediated functions of p53, p63 and p73 proteins in cancer biology
Identifikační kód projektu: 19-15168S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2019 - 2021
Řešitel: Marie Brázdová
Comparative study of DNA interacting properties of the tumor suppressor p53 protein isoforms
Identifikační kód projektu: 18-155485
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2018 - 2020
Řešitel: Václav Brázda
New tools of label-free electrochemical analysis of protein interactions with nucleic acids and proteins
Identifikační kód projektu: 18-18154S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2018 - 2020
Řešitel: Veronika Ostatná
Nanostrukturované povrchy stříbrného amalgámu pro elektrochemické a optické metody analýzy biomolekul
Identifikační kód projektu: GJ17-23634Y
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2017 - 2019
Řešitel: Daňhel Aleš
Chemical modification and electrochemical analysis of nucleic acids as a new tool in molecular oncology
Identifikační kód projektu: 17-08971S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2017 - 2019
Řešitel: Veronika Ostatná
Struktura DNA v roztoku a na površích elektrod: elektrochemické metody jako účinné nástroje analýzy struktury a interakcí DNA
Identifikační kód projektu: 16-01625S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2016 - 2018
Řešitel: Miroslav Fojta
Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
Identifikační kód projektu: GBP206/12/G151
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2012 - 2018
Řešitel: Miroslav Fojta
New tools for research and diagnostics of diseases. Microfluidic reactors and electrochemistry for analysis of proteins and their glycosylation.
Identifikační kód projektu: 15-15479S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2015 - 2017
Řešitel: Emil Paleček
Influence of conformation motifs and epigenetic modifications to DNA binding properties of p53 family proteins
Identifikační kód projektu: 15-21855S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2015 - 2017
Řešitel: Václav Brázda
Novel reactive groups introduced in nucleic acids for modification with oxoosmium complexes: structural and analytical aspects.
Identifikační kód projektu: 15-08434S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2015 - 2017
Řešitel: Luděk Havran
Interactions of p53 family proteins with biologically significant DNA quadruplexes
Identifikační kód projektu: 13-36108S
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2013 - 2015
Řešitel: Marie Brázdová
Rozvoj moderních trendů v experimentální biologii: význam biomolekulárních interakcí pro funkci buněčných struktur
Identifikační kód projektu: EE2.3.30.0019
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2012 - 2015
Řešitel: Miroslav Fojta
Optical and electrochemical approaches to study the adsorption behavior of proteins at the metal interfaces for use in medical applications
Identifikační kód projektu: M200041209
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2012 - 2015
Řešitel: Stanislav Hasoň
Nové elektrochemické senzory a detekční techniky pro analýzu struktury a interakcí nukleových kyselin.
Identifikační kód projektu: GAP206/11/1638
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2011 - 2015
Řešitel: Miroslav Fojta
Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73
Identifikační kód projektu: GAP301/11/2076
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2011 - 2015
Řešitel: Hana Pivoňková
Influence of conformation and chemical modification on the behaviour of oligonucleotides at electrodes: towards the development of DNA sensors
Identifikační kód projektu: P206/12/2378
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2012 - 2014
Řešitel: Luděk Havran
Induced organization of biomolecules at interfaces by interacting with electrically charged surfaces as a tool for medical diagnostics
Identifikační kód projektu: P205/10/2378
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2010 - 2014
Řešitel: Stanislav Hasoň
Spectroscopic and electrochemical characterization of photo-oxidized proteins
Identifikační kód projektu: 7AMB12AR028
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2012 - 2013
Řešitel: Veronika Ostatná
Značení DNA redoxními markery pro elektrochemickou detekci. Aplikace v analýze nukleotidových sekvencí a v molekulární diagnostice.
Identifikační kód projektu: IAA400040901
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2009 - 2013
Konstrukce nových funkčních nukleových kyselin pro aplikace v chemické biologii, katalýze a samoskladbě
Identifikační kód projektu: GA203/09/0317
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2009 - 2013
The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer.
Identifikační kód projektu: P301/10/2370
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2010 - 2012
Řešitel: Marie Brázdová
Reaction of Six-valent and Eight-valent Osmium Complexes with Biomacromolecules and Their Application in Biomedicine.
Identifikační kód projektu: P301/10/P548
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2010 - 2012
Řešitel: Mojmír Trefulka
Transcriptional activities of wild-type and mutant p53, decision between cell proliferation, cell cycle arrest and apoptosis.
Identifikační kód projektu: 301/10/1211
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2010 - 2012
Řešitel: Václav Brázda
Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii
Identifikační kód projektu: EE2.3.09.0046
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2009 - 2012
Interakce proteinů a nukleových kyselin s povrchy. Nové nástroje pro biomedicínu
Identifikační kód projektu: ME09038
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2009 - 2012
Aggregation of alpha synuclein in Parkinson's disease
Název programu: Programme of International Collaboration of the AS CR
Koordinátor / pracoviště: Veronika Ostatná, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Spolupracovník: Emil Paleček, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Řešení projektu: 2009 - 2012
Účastnické země: Germany, Czech Republic
Complex interaction of oncology-related important transcription factors with target DNA in vitro and in vivo
Název programu: Academy of Sciences of the Czech Republic, international cooperation
Koordinátor / pracoviště: Václav Brázda, Ph.D., Institute of Biophysics ASCR, v.v.i.
Spolupracovník: Cheryl Arrowsmith, Ph.D., Ontario Cancer Institute, Toronto, Canada
Řešení projektu: 2009 - 2012
Účastnické země: Czech Republic, Canada
Aggregation of alpha synuclein in Parkinson’s disease.
Identifikační kód projektu: M20004090
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2009 - 2012
Řešitel: Veronika Ostatná
Complex interaction of oncology-related important transcription factors with target DNA in vitro and in vivo.
Identifikační kód projektu: M200040904
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2009 - 2012
Řešitel: Václav Brázda
Interactions of proteins and nucleic acids with surfaces. New tools for biomedicine.
Název programu: ME - KONTAKT
Koordinátor / pracoviště: J.Wang, Dept.Nanoengineering, La Jolla, CA 92093-0448, USA
Spolupracovník: Emil Paleček, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Řešení projektu: 1996 - 2012
Účastnické země: USA, Czech Republic
Mezifázové a elektrochemické chování syntetických oligonukleotidů: vliv nukleotidové sekvence, konformace a chemické modifikace
Identifikační kód projektu: IAA400040903
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2009 - 2011
Mezifázové vlastnosti alfa-synucleinu a agregace tohoto proteinu v Parkinsonově nemoci
Identifikační kód projektu: KJB100040901
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2009 - 2011
Stomatologické výzkumné centrum.
Identifikační kód projektu: M0528
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2005 - 2011
Aplikace elektrochemických metod zaměřených na mikroanalýzu bází nukleových kyselin a oligonukleotidů
Identifikační kód projektu: IAA400040804
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2008 - 2010
Využití fyzikálních metod studia adsorpce nukleových kyselin a proteinů na rozhraních v lékařské diagnostice a při studiu biokompatibility
Identifikační kód projektu: GA202/08/1688
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2008 - 2010
Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA
Identifikační kód projektu: GA204/08/1560
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2008 - 2010
Elektrochemické nástroje pro detekci mutací a polymorfismů v DNA
Identifikační kód projektu: GP203/08/P598
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2008 - 2010
Interakce standardního a mutantních proteinů p53 s poškozenou DNA a jejich význam při odpovědi buněk na protinádorovou chemoterapii
Identifikační kód projektu: IAA500040701
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2007 - 2010
Elektrochemická a optická analýza biomakromolekul na mikroelektrodách pokrytých nanovrstvami elektroaktivního materiálu
Identifikační kód projektu: KAN200040651
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2006 - 2010
Nanotechnologie pro proteinovou a genovou diagnostiku
Identifikační kód projektu: KAN400310651
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2006 - 2010
Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Identifikační kód projektu: LC06035
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2006 - 2010
Analýza struktury a interakcí DNA pomocí elektrochemických technik a chemických sond. Nové metody a senzory pro detekci poškození DNA
Identifikační kód projektu: GA203/07/1195
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2007 - 2009
Elektrody modifikované proteiny a DNA. Nové nástroje pro biomedicínu
Identifikační kód projektu: GA301/07/0490
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2007 - 2009
Interakce proteinů s povrchy. Nové biofyzikální metody analýzy nádorového supresoru p53
Identifikační kód projektu: GP202/07/P497
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2007 - 2009
Interakce proteinu p73 a jeho isoforem s DNA. Vliv nadšroubovicového vinutí, konformace DNA a protinádorových činidel
Identifikační kód projektu: GP204/07/P476
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2007 - 2009
Studium posttranslační modifikace nádorového supresoru proteinu p53, jeho homologů a interagujících proteinů v lidských nádorových buněčných liniích
Identifikační kód projektu: GP301/07/P160
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2007 - 2009
Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.
Identifikační kód projektu: IAA100040602
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2006 - 2008
Využití elektrochemických metod při studiu oligonukleotidů jako modelů alternativních struktur DNA
Identifikační kód projektu: IAA400040611
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2006 - 2008
Mikroanalytická instrumentace pro analýzy biopolymerů modifikovaných strukturními sondami
Identifikační kód projektu: GA203/06/1685
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2006 - 2008
DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53
Identifikační kód projektu: GP204/06/P369
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2006 - 2008
Standardní (wild type) a mutovaný nádorový supresor protein p53. Mezimolekulární interakce, změny konformace a nové mikrometody jeho analysy
Identifikační kód projektu: IAA500040513
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2005 - 2008
Aplikace biofyzikálních metod v biotechnologii a v biomedicině.
Identifikační kód projektu: ME 920
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2007 - 2007
Mutanty nádorového supresoru proteinu p53 a regulace jejich DNA vazebné aktivity
Identifikační kód projektu: KJB500040502
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2005 - 2007
Konjugáty nukleobází s komplexy kovů jako elektroaktivní značky. Využití značených oligonukleotidů v senzorech pro hybridizaci DNA
Identifikační kód projektu: GA203/05/0043
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2005 - 2007
Sensibilizace nádorových buněk k chemoterapeutikům cílenými inaktivacemi p53-kináz a homologů p53 jako možná terapeutická strategie v onkologii
Identifikační kód projektu: GA301/05/0416
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2005 - 2007
Elektrochemické detektory hybridizace DNA a jejich aplikace v DNA diagnostice
Identifikační kód projektu: IAA4004402
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2004 - 2007
Výzkum a vývoj nového typu elektrochemického biosenzoru pro detekci sekvence nukleotidů v DNA a genotoxických agens v prostředí.
Identifikační kód projektu: 1H-PK/42
Poskytovatel: MPO
Řešení projektu: 2004 - 2007
Interakce mutantních proteinů p53 s genomovou DNA in vitro a in vivo
Identifikační kód projektu: 1K04119
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2004 - 2007
Interakce biopolymerů s ligandy a detekce jejich konformačních změn na fázových rozhraních pomocí elektrochemických a optických metod
Identifikační kód projektu: IAA4004404
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2004 - 2006
Nové přístupy ve vývoji elektrochemických senzorů pro poškození DNA
Identifikační kód projektu: GA203/04/1325
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2004 - 2006
Vliv superhelicity DNA na sekvenčně specifickou a strukturně selektivní vazbu proteinu p53
Identifikační kód projektu: GP301/04/P025
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2004 - 2006
Možnosti elektrochemických metod v genomice, základy vývoje biosenzorů DNA
Identifikační kód projektu: IBS5004355
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2003 - 2005
Využití chemických strukturních sond a elektroanalytických metod při detekci poškození DNA. Vývoj DNA senzorů.
Identifikační kód projektu: KJB4004302
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2003 - 2005
Chemicky modifikované pevné elektrody v elektrochemické analýze nukleových kyselin a jejich složek
Identifikační kód projektu: KJB4004305
Poskytovatel: GA AV
Řešení projektu: 2003 - 2005
Využití elektrochemie v analýze proteinů a při detekci hybridizace DNA
Identifikační kód projektu: GA204/03/0566
Poskytovatel: GA ČR
Řešení projektu: 2003 - 2005
Vývoj metod a konstrukce sensorů pro detekci interakcí DNA s léky
Identifikační kód projektu: ME 685
Poskytovatel: MŠMT
Řešení projektu: 2003 - 2005
Rozpoznání poškození DNA nádorově supresorovými proteiny. Vliv protinádorových léčiv.
Identifikační kód projektu: NC7574
Poskytovatel: MZ
Řešení projektu: 2003 - 2005
Aplikace biofyzikálních metod v biotechnologické a klinické praxi
Identifikační kód projektu: IBS5004107
Poskytovatel: AV ČR
Řešení projektu: 2001 - 2005
Interakce nádorově supresorových proteinů s DNA. Úlohy konformace DNA a modifikací proteinu.
Identifikační kód projektu: GA204/02/0734
Poskytovatel: GAČR
Řešení projektu: 2002 - 2004
Řešitel: GA204/02/0734
Vývoj elektrochemických biodetektorů pro poškození DNA.
Identifikační kód projektu: IAA4004108
Řešení projektu: 2001 - 2003
Řešitel: Miroslav Fojta
Interakce nádorově supresorového proteinu p53 s poškozenou DNA a s DNA vystavenou působení léků proti nádorovým onemocněním.
Identifikační kód projektu: NC5343
Řešení projektu: 1999 - 2001
Řešitel: Miroslav Fojta
Elektrody jako regulátory štěpení imobilizované DNA chemickými nukleázami závislými na redoxních reakcích.
Identifikační kód projektu: IAA4004801
Řešení projektu: 1998 - 2000
Řešitel: Miroslav Fojta
Application of biophysical methods in biotechnology and biomedicine
Název programu: KONTAKT 7_2006_19 Ministry of Education of the CR - Bilateral Czech-Greek Scientific-Technical Cooperation
Koordinátor / pracoviště: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Spolupracovník: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Řešení projektu: 2006 - 0
Účastnické země: Slovakia, Czech Republic
6FP EU, MERG-6-CT-2005-014875, European Reintegration Grant, „Novel interactions of mutant p53 with genomic DNA in vitro and in vivo“,
Název programu: FP6-MOBILITY, Sixth Framework Programme, Marie Curie European Reintegration Grants (ERG)
Koordinátor / pracoviště: Emil Paleček, Institute of Biophysics, AS CR, Brno
Spolupracovník: Marie Brázdová, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Czech Republic
Mutant p53 a target for improved cancer treatment
Název programu: EU LSHC-CT-2004- 502983
Koordinátor / pracoviště: Klas Wiman, Karolinska Institute, Sweden
Spolupracovník: Emil Paleček, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Sweden, Holland, Germany, Italy, Norway, Israel, England, France, Estonia, Czech Republic
New chemical and biochemical sensors for analysis of food, enviromental and medical samples
Název programu: Sixth Framework Programme - Marie Curie Host Fellowships - Transfer of knowledge (TOK) - Development Scheme
Koordinátor / pracoviště: Jerzy Radecki, Institute of animal reproduction and food research - Polish Academy of Sciences, Olsztyn, Poland
Spolupracovník: Emil Paleček, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Poland, Czech Republic,
Development of methods and construction of sensors for the detection of interaction of DNA with drugs
Název programu: KONTAKT ME 685 Ministry of Education of the CR - Bilateral Czech-Greek Cooperation
Koordinátor / pracoviště: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Spolupracovník: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Greece, Czech Republic
Study of DNA hybridization at surfaces
Název programu: KONTAKT 94 Ministry of Education of the CR - Bilateral Czech-Slovak Cooperation
Koordinátor / pracoviště: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Spolupracovník: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Greece, Czech Republic
Application of biophysical methods in biotechnology and biomedicine
Název programu: KONTAKT ME 920 Ministry of Education of the CR - Bilateral Czech-Greek Cooperation
Koordinátor / pracoviště: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Spolupracovník: Vladimír Vetterl, Institute of Biophysics, AS CR, Brno, Czech Republic
Účastnické země: Slovakia, Czech Republic