Vedení Biofyzikálního ústavu AV ČR, v. v. i.,
Královopolská 2590/135, 612 00 Brno
vypisuje výběrové řízení
Pracovní pozice: Doktorand/ka - bioinformatika
Vědecké oddělení: Oddělení biofyziky imunitního systému
Projekt: NW25-08-00135 - Biodegradovatelné polyesterové nanomateriály jako biotechnologická platforma pro cílenou terapii revmatoidní artitidy, Poskytovatel: Agentura pro zdravotnický výzkum
Velikost pracovního úvazku: 0,65
Doba trvání pracovního poměru: 1. 10. 2026 – 31. 12. 2027
Minimální dosažené vzdělání: magisterské
Kvalifikační úroveň: V2
Odborné požadavky:
- Znalost principů molekulární a buněčné imunologie, zejména biologie T a B lymfocytů, antigenně specifické imunitní odpovědi, TCR/BCR signalizace a mechanismů autoimunitních a chronických zánětlivých onemocnění.
- Zkušenost se základními metodami experimentální imunologie a molekulární biologie, zejména se zpracováním primárních biologických vzorků, přípravou vzorků nebo knihoven pro sekvenování a kultivací buněk.
- Znalost analýzy vysokodimenzionálních biologických dat a zkušenost s jejich statistickým zpracováním v prostředí R a/nebo Python.
- Znalost zpracování a bioinformatické analýzy transkriptomických dat získaných metodami bulk RNA-seq a single-cell RNA-seq, včetně kontroly kvality, normalizace, integrace dat a diferenciální expresní analýzy.
- Znalost principů analýzy TCR a/nebo BCR repertoáru, včetně hodnocení klonality, diverzity, klonální expanze a konvergence receptorových sekvencí.
- Zkušenost s využíváním veřejně dostupných transkriptomických a sekvenačních databází a se systematickým zpracováním a integrací dat pocházejících z více nezávislých datasetů.
- Znalost funkční a pathway analýzy transkriptomických dat, včetně metod gene-set enrichment a využití biologických databází, jako jsou Gene Ontology, KEGG nebo Reactome.
- Znalost principů strukturní bioinformatiky a molekulárního modelování proteinů, zejména predikce 3D struktury receptorů, analýzy protein–protein/protein–peptidových interakcí a predikce antigenních epitopů.
- Schopnost propojit bioinformatickou analýzu s experimentální validací výsledků, včetně návrhu experimentů pro funkční ověření kandidátních receptorů, antigenů nebo molekulárních markerů.
Jazykové požadavky: Anglický jazyk, min. úroveň B2
Zaměstnanecké benefity:
- 25 dní dovolené + 3 sick days,
- flexibilní pracovní doba,
- možnost částečného home office,
- odborné a jazykové kurzy,
- až 10 000 Kč ročně na rekreaci, sportovní aktivity nebo kulturu,
- finančně zvýhodněné závodní stravování,
- vitamínové doplňky, zajištění pitného režimu zdarma,
- sportovní a kulturní teambuildingové akce.
Předpokládaný termín nástupu: 1. 10. 2026
Nejzazší termín pro podání přihlášky: 17. 9. 2026
Přihlášky k výběrovému řízení včetně CV, zasílejte elektronicky na e-mailové adresy kubalal@ibp.cz a ulrich@ibp.cz, případně korespondenčně na adresu Královopolská 2590/135, 612 00 Brno, Česká republika, s viditelným označením „výběrové řízení + konkrétní pracovní pozice“ na obálce.