Vědecká skupina kolem prof. Šponera publikuje článek v Journal of Chemical Theory and Compution.

23. 11. 2023

Vědecká skupina prof. Šponera z oddělení Struktury a dynamiky nukleonových kyselin, má nový článek v žurnálu Americké Chemické Společnosti (ACS) - Journal of Chemical Theory and Compution.

Profesor Jiří Šponer z Biofyzikálního ústavu se se svým týmem intenzivně věnuje vývoji empirických potenciálů (silových polí) pro molekulové dynamické simulace nukleových kyselin.



V aktuální práci identifikovali artefakt v silovém potenciálu, kdy se atomy popisující interakci báze-fosfát dostávají do sterického konfliktu. Daný defekt v silových potenciálech zůstával skryt vývojářům silových polí po celou poslední dekádu. Vědci navrhli a otestovali jednoduchou opravu, která výrazně zlepšuje chování těchto potenciálů pro studium struktury a dynamiky nukleových kyselin.
 

CELÝ ČLÁNEK PRO PŘEČTENÍ V ODKAZE ZDE