| size | 2160 |
| size_real | 2160 |
| ecount | 13069 |
| supercluster | 68 |
| annotations_summary | 0.05% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-INT |
| pair_completeness | 0.487603305785124 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000462962962962963 |
| satellite_probability | 2.89707838193454e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 0 |
| S5 | 3 |
| S4 | 3 |
| S7 | 0 |
| S9 | 3 |
| S6 | 7 |
| S2 | 699 |
| S1 | 746 |
| S3 | 699 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 4.0 | 2.5 | 1.0 |
| S4 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 9.5 | 8.5 | 5.0 |
| S7 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S9 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 7.5 | 4.5 | 5.5 |
| S6 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 1.0 | 9.0 | 12.5 | 5.0 |
| S2 | 0 | 4.0 | 9.5 | 0 | 7.5 | 9.0 | 1530.0 | 1520.0 | 1400.0 |
| S1 | 0 | 2.5 | 8.5 | 0 | 4.5 | 12.5 | 1520.0 | 1640.0 | 1310.0 |
| S3 | 0 | 1.0 | 5.0 | 0 | 5.5 | 5.0 | 1400.0 | 1310.0 | 1280.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S5 | NA | 0.000 | 0.000 | NA | 0.000 | 0.000 | 1.550 | 0.969 | 0.434 |
| S4 | NA | 0.000 | 0.000 | NA | 0.000 | 0.000 | 1.200 | 1.070 | 0.708 |
| S7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S9 | NA | 0.000 | 0.000 | NA | 0.000 | 0.000 | 1.250 | 0.747 | 1.020 |
| S6 | NA | 0.000 | 0.000 | NA | 0.000 | 17.300 | 0.954 | 1.320 | 0.592 |
| S2 | NA | 1.550 | 1.200 | NA | 1.250 | 0.954 | 0.995 | 0.987 | 1.020 |
| S1 | NA | 0.969 | 1.070 | NA | 0.747 | 1.320 | 0.987 | 1.060 | 0.949 |
| S3 | NA | 0.434 | 0.708 | NA | 1.020 | 0.592 | 1.020 | 0.949 | 1.040 |
protein domains:
|
|
||||||||
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL148 ----> CL23
No. of shared pairs: :73
CL148 ----> CL125
No. of shared pairs: :42
CL148 ----> CL171
No. of shared pairs: :17
CL148 ----> CL847
No. of shared pairs: :16