size | 3948 |
size_real | 3948 |
ecount | 35305 |
supercluster | 6 |
annotations_summary | 0.03% Class_I/LINE:LINE-ENDO |
pair_completeness | 0.685019206145967 |
pbs_score | None |
TR_score | None |
TR_monomer_length | None |
loop_index | 0.0220364741641337 |
satellite_probability | 1.69778801131436e-20 |
consensus | None |
TAREAN_annotation | Other |
orientation_score | 1 |
Species | Read count |
---|---|
S8 | 4 |
S5 | 1330 |
S4 | 1360 |
S7 | 5 |
S9 | 4 |
S6 | 1240 |
S2 | 6 |
S1 | 2 |
S3 | 2 |
S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S8 | 0.0 | 13.5 | 17.5 | 0.0 | 0.0 | 13.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
S5 | 13.5 | 3750.0 | 4020.0 | 4.0 | 10.5 | 3610.0 | 15.0 | 9.0 | 4.0 |
S4 | 17.5 | 4020.0 | 4560.0 | 3.0 | 7.0 | 3950.0 | 21.0 | 8.5 | 2.0 |
S7 | 0.0 | 4.0 | 3.0 | 1.0 | 0.0 | 3.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
S9 | 0.0 | 10.5 | 7.0 | 0.0 | 0.0 | 8.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
S6 | 13.0 | 3610.0 | 3950.0 | 3.5 | 8.0 | 3510.0 | 13.5 | 7.5 | 3.5 |
S2 | 0.0 | 15.0 | 21.0 | 0.0 | 0.0 | 13.5 | 2.0 | 0.0 | 0.0 |
S1 | 0.0 | 9.0 | 8.5 | 0.0 | 0.0 | 7.5 | 0.0 | 0.0 | 0.5 |
S3 | 0.0 | 4.0 | 2.0 | 0.0 | 0.0 | 3.5 | 0.0 | 0.5 | 0.0 |
S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S8 | 0.000 | 0.947 | 1.120 | 0.000 | 0.000 | 0.938 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
S5 | 0.947 | 1.010 | 0.986 | 1.070 | 1.270 | 1.000 | 0.899 | 1.090 | 1.230 |
S4 | 1.120 | 0.986 | 1.020 | 0.732 | 0.770 | 0.996 | 1.140 | 0.935 | 0.561 |
S7 | 0.000 | 1.070 | 0.732 | 267.000 | 0.000 | 0.966 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
S9 | 0.000 | 1.270 | 0.770 | 0.000 | 0.000 | 0.996 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
S6 | 0.938 | 1.000 | 0.996 | 0.966 | 0.996 | 1.000 | 0.832 | 0.934 | 1.110 |
S2 | 0.000 | 0.899 | 1.140 | 0.000 | 0.000 | 0.832 | 26.600 | 0.000 | 0.000 |
S1 | 0.000 | 1.090 | 0.935 | 0.000 | 0.000 | 0.934 | 0.000 | 0.000 | 69.200 |
S3 | 0.000 | 1.230 | 0.561 | 0.000 | 0.000 | 1.110 | 0.000 | 69.200 | 0.000 |
protein domains:
|
|
||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|