| size | 4211 |
| size_real | 4211 |
| ecount | 223468 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.02% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.523516642547033 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.078366183804322 |
| satellite_probability | 1.01644100311071e-16 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 3 |
| S5 | 1380 |
| S4 | 1390 |
| S7 | 2 |
| S9 | 5 |
| S6 | 1430 |
| S2 | 2 |
| S1 | 0 |
| S3 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 1 | 126.0 | 128.0 | 0.0 | 0.0 | 117.0 | 0.0 | 0 | 0 |
| S5 | 126 | 23100.0 | 23700.0 | 7.0 | 64.0 | 24700.0 | 9.5 | 0 | 0 |
| S4 | 128 | 23700.0 | 24700.0 | 8.5 | 66.5 | 25500.0 | 10.5 | 0 | 0 |
| S7 | 0 | 7.0 | 8.5 | 0.0 | 0.0 | 7.0 | 0.0 | 0 | 0 |
| S9 | 0 | 64.0 | 66.5 | 0.0 | 0.0 | 75.5 | 0.0 | 0 | 0 |
| S6 | 117 | 24700.0 | 25500.0 | 7.0 | 75.5 | 26700.0 | 8.0 | 0 | 0 |
| S2 | 0 | 9.5 | 10.5 | 0.0 | 0.0 | 8.0 | 0.0 | 0 | 0 |
| S1 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0 |
| S3 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 1.610 | 1.050 | 1.040 | 0.000 | 0.000 | 0.911 | 0.000 | NA | NA |
| S5 | 1.050 | 1.000 | 0.996 | 0.970 | 0.968 | 1.000 | 1.060 | NA | NA |
| S4 | 1.040 | 0.996 | 1.010 | 1.140 | 0.974 | 0.996 | 1.130 | NA | NA |
| S7 | 0.000 | 0.970 | 1.140 | 0.000 | 0.000 | 0.902 | 0.000 | NA | NA |
| S9 | 0.000 | 0.968 | 0.974 | 0.000 | 0.000 | 1.060 | 0.000 | NA | NA |
| S6 | 0.911 | 1.000 | 0.996 | 0.902 | 1.060 | 1.000 | 0.829 | NA | NA |
| S2 | 0.000 | 1.060 | 1.130 | 0.000 | 0.000 | 0.829 | 0.000 | NA | NA |
| S1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
protein domains:
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|
CL72 ----> CL49
No. of shared pairs: :402
CL72 ----> CL47
No. of shared pairs: :150
CL72 ----> CL109
No. of shared pairs: :24
CL72 ----> CL45
No. of shared pairs: :16
CL72 ----> CL20
No. of shared pairs: :14