| size | 4693 |
| size_real | 4693 |
| ecount | 420667 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Chlamyvir:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.465646470955653 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00170466652461112 |
| satellite_probability | 3.54668226065428e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 0 |
| S5 | 1550 |
| S4 | 1510 |
| S7 | 0 |
| S9 | 4 |
| S6 | 1610 |
| S2 | 6 |
| S1 | 0 |
| S3 | 6 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 |
| S5 | 0 | 49900 | 44900 | 0 | 206.0 | 49200 | 292.0 | 0 | 194.0 |
| S4 | 0 | 44900 | 41000 | 0 | 186.0 | 44500 | 254.0 | 0 | 174.0 |
| S7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 |
| S9 | 0 | 206 | 186 | 0 | 0.0 | 199 | 0.5 | 0 | 1.5 |
| S6 | 0 | 49200 | 44500 | 0 | 199.0 | 48700 | 272.0 | 0 | 190.0 |
| S2 | 0 | 292 | 254 | 0 | 0.5 | 272 | 1.0 | 0 | 1.0 |
| S1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0 | 0.0 |
| S3 | 0 | 194 | 174 | 0 | 1.5 | 190 | 1.0 | 0 | 1.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S5 | NA | 1.000 | 0.996 | NA | 1.010 | 1.000 | 1.030 | NA | 1.000 |
| S4 | NA | 0.996 | 1.010 | NA | 1.010 | 0.999 | 0.994 | NA | 0.993 |
| S7 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S9 | NA | 1.010 | 1.010 | NA | 0.000 | 0.989 | 0.432 | NA | 1.900 |
| S6 | NA | 1.000 | 0.999 | NA | 0.989 | 1.000 | 0.975 | NA | 0.999 |
| S2 | NA | 1.030 | 0.994 | NA | 0.432 | 0.975 | 0.623 | NA | 0.912 |
| S1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S3 | NA | 1.000 | 0.993 | NA | 1.900 | 0.999 | 0.912 | NA | 1.340 |
protein domains:
|
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|
CL67 ----> CL101
No. of shared pairs: :343
CL67 ----> CL44
No. of shared pairs: :42
CL67 ----> CL29
No. of shared pairs: :29
CL67 ----> CL1
No. of shared pairs: :11
CL67 ----> CL2
No. of shared pairs: :11
CL67 ----> CL3
No. of shared pairs: :11
CL67 ----> CL26
No. of shared pairs: :11
CL67 ----> CL33
No. of shared pairs: :11
CL67 ----> CL6
No. of shared pairs: :10