| size | 5022 |
| size_real | 5022 |
| ecount | 20543 |
| supercluster | 28 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-PROT 0.02% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.436909871244635 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000199123855037834 |
| satellite_probability | 4.69379822868744e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 0 |
| S5 | 1750 |
| S4 | 1660 |
| S7 | 6 |
| S9 | 3 |
| S6 | 1600 |
| S2 | 4 |
| S1 | 3 |
| S3 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S5 | 0 | 2600.0 | 2330.0 | 7.0 | 0.5 | 2200.0 | 3.5 | 3.0 | 0 |
| S4 | 0 | 2330.0 | 2370.0 | 5.0 | 1.0 | 2150.0 | 5.5 | 1.5 | 0 |
| S7 | 0 | 7.0 | 5.0 | 0.0 | 0.0 | 1.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S9 | 0 | 0.5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S6 | 0 | 2200.0 | 2150.0 | 1.5 | 0.5 | 2140.0 | 2.5 | 4.5 | 0 |
| S2 | 0 | 3.5 | 5.5 | 0.0 | 0.0 | 2.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S1 | 0 | 3.0 | 1.5 | 0.0 | 0.0 | 4.5 | 0.0 | 1.0 | 0 |
| S3 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S5 | NA | 1.050 | 0.977 | 1.490 | 0.479 | 0.973 | 0.875 | 0.862 | NA |
| S4 | NA | 0.977 | 1.030 | 1.110 | 0.998 | 0.990 | 1.430 | 0.449 | NA |
| S7 | NA | 1.490 | 1.110 | 0.000 | 0.000 | 0.352 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S9 | NA | 0.479 | 0.998 | 0.000 | 2280.000 | 0.527 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S6 | NA | 0.973 | 0.990 | 0.352 | 0.527 | 1.040 | 0.688 | 1.420 | NA |
| S2 | NA | 0.875 | 1.430 | 0.000 | 0.000 | 0.688 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S1 | NA | 0.862 | 0.449 | 0.000 | 0.000 | 1.420 | 0.000 | 205.000 | NA |
| S3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
protein domains:
|
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|
CL60 ----> CL146
No. of shared pairs: :122
CL60 ----> CL28
No. of shared pairs: :43
CL60 ----> CL71
No. of shared pairs: :33
CL60 ----> CL119
No. of shared pairs: :19
CL60 ----> CL3
No. of shared pairs: :13