| size | 5232 |
| size_real | 5232 |
| ecount | 61869 |
| supercluster | 25 |
| annotations_summary | 0.17% organelle/mitochondria 0.17% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-I:Ty1-INT 0.02% Class_I/LINE:LINE-RT |
| pair_completeness | 0.56975697569757 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0349971313826736 |
| satellite_probability | 1.3998528815492e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999967677812434 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 1 |
| S5 | 1730 |
| S4 | 1780 |
| S7 | 6 |
| S9 | 2 |
| S6 | 1700 |
| S2 | 5 |
| S1 | 1 |
| S3 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 1.5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 3.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S5 | 1.5 | 6890.0 | 6980.0 | 18.5 | 21.0 | 6450.0 | 18.5 | 2.0 | 0 |
| S4 | 1.0 | 6980.0 | 7710.0 | 20.0 | 29.0 | 6830.0 | 29.5 | 4.5 | 0 |
| S7 | 0.0 | 18.5 | 20.0 | 2.0 | 0.0 | 21.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S9 | 0.0 | 21.0 | 29.0 | 0.0 | 0.0 | 23.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S6 | 3.5 | 6450.0 | 6830.0 | 21.0 | 23.5 | 6350.0 | 17.5 | 0.0 | 0 |
| S2 | 0.0 | 18.5 | 29.5 | 0.0 | 0.0 | 17.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S1 | 0.0 | 2.0 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 0.759 | 0.478 | 0.000 | 0.000 | 1.830 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S5 | 0.759 | 1.030 | 0.981 | 0.913 | 0.867 | 0.995 | 0.857 | 0.934 | NA |
| S4 | 0.478 | 0.981 | 1.020 | 0.932 | 1.130 | 0.993 | 1.290 | 1.980 | NA |
| S7 | 0.000 | 0.913 | 0.932 | 32.700 | 0.000 | 1.070 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S9 | 0.000 | 0.867 | 1.130 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S6 | 1.830 | 0.995 | 0.993 | 1.070 | 1.000 | 1.010 | 0.840 | 0.000 | NA |
| S2 | 0.000 | 0.857 | 1.290 | 0.000 | 0.000 | 0.840 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S1 | 0.000 | 0.934 | 1.980 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | NA |
| S3 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
protein domains:
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