| size | 6600 |
| size_real | 6600 |
| ecount | 247611 |
| supercluster | 12 |
| annotations_summary | 0.06% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII |
| pair_completeness | 0.697094368732322 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.09 |
| satellite_probability | 1.91457577178322e-17 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 4 |
| S5 | 2100 |
| S4 | 2310 |
| S7 | 4 |
| S9 | 3 |
| S6 | 2160 |
| S2 | 10 |
| S1 | 4 |
| S3 | 2 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 1.0 | 19.5 | 19.0 | 0.0 | 0.0 | 16.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 19.5 | 24900.0 | 27200.0 | 61.5 | 31.0 | 25900.0 | 89.5 | 123.0 | 41.0 |
| S4 | 19.0 | 27200.0 | 30300.0 | 65.5 | 44.5 | 28500.0 | 105.0 | 129.0 | 39.0 |
| S7 | 0.0 | 61.5 | 65.5 | 0.0 | 0.0 | 50.0 | 0.5 | 0.5 | 0.0 |
| S9 | 0.0 | 31.0 | 44.5 | 0.0 | 0.0 | 40.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 16.0 | 25900.0 | 28500.0 | 50.0 | 40.5 | 27000.0 | 88.5 | 129.0 | 38.0 |
| S2 | 0.0 | 89.5 | 105.0 | 0.5 | 0.0 | 88.5 | 3.0 | 0.0 | 0.5 |
| S1 | 0.0 | 123.0 | 129.0 | 0.5 | 0.0 | 129.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| S3 | 0.0 | 41.0 | 39.0 | 0.0 | 0.0 | 38.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 80.400 | 1.110 | 0.981 | 0.000 | 0.000 | 0.874 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S5 | 1.110 | 1.000 | 0.996 | 1.090 | 0.845 | 1.000 | 0.986 | 1.020 | 1.090 |
| S4 | 0.981 | 0.996 | 1.000 | 1.050 | 1.100 | 0.999 | 1.050 | 0.966 | 0.943 |
| S7 | 0.000 | 1.090 | 1.050 | 0.000 | 0.000 | 0.851 | 2.420 | 1.820 | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 0.845 | 1.100 | 0.000 | 0.000 | 1.060 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S6 | 0.874 | 1.000 | 0.999 | 0.851 | 1.060 | 1.000 | 0.934 | 1.020 | 0.972 |
| S2 | 0.000 | 0.986 | 1.050 | 2.420 | 0.000 | 0.934 | 9.020 | 0.000 | 3.640 |
| S1 | 0.000 | 1.020 | 0.966 | 1.820 | 0.000 | 1.020 | 0.000 | 1.690 | 0.000 |
| S3 | 0.000 | 1.090 | 0.943 | 0.000 | 0.000 | 0.972 | 3.640 | 0.000 | 0.000 |
protein domains:
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