| size | 6758 |
| size_real | 6758 |
| ecount | 114661 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 0.03% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.551423324150597 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0403965670316662 |
| satellite_probability | 4.10822619131233e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 3 |
| S5 | 2350 |
| S4 | 2200 |
| S7 | 5 |
| S9 | 10 |
| S6 | 2180 |
| S2 | 7 |
| S1 | 5 |
| S3 | 1 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0 | 20.0 | 12.0 | 0.0 | 0.0 | 13.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 20 | 12900.0 | 12900.0 | 44.5 | 52.5 | 12300.0 | 57.0 | 32.5 | 29.0 |
| S4 | 12 | 12900.0 | 13000.0 | 35.0 | 60.5 | 12400.0 | 50.0 | 25.5 | 41.5 |
| S7 | 0 | 44.5 | 35.0 | 1.0 | 0.0 | 34.5 | 0.5 | 0.0 | 0.0 |
| S9 | 0 | 52.5 | 60.5 | 0.0 | 0.0 | 56.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 13 | 12300.0 | 12400.0 | 34.5 | 56.5 | 12000.0 | 54.0 | 25.5 | 37.5 |
| S2 | 0 | 57.0 | 50.0 | 0.5 | 0.0 | 54.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 |
| S1 | 0 | 32.5 | 25.5 | 0.0 | 0.0 | 25.5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| S3 | 0 | 29.0 | 41.5 | 0.0 | 0.0 | 37.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 1.330 | 0.792 | 0.000 | 0.000 | 0.896 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S5 | 1.330 | 1.000 | 1.000 | 1.150 | 0.925 | 0.993 | 1.050 | 1.150 | 0.802 |
| S4 | 0.792 | 1.000 | 1.000 | 0.900 | 1.060 | 0.999 | 0.914 | 0.896 | 1.140 |
| S7 | 0.000 | 1.150 | 0.900 | 8.600 | 0.000 | 0.926 | 3.050 | 0.000 | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 0.925 | 1.060 | 0.000 | 0.000 | 1.030 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S6 | 0.896 | 0.993 | 0.999 | 0.926 | 1.030 | 1.010 | 1.030 | 0.936 | 1.080 |
| S2 | 0.000 | 1.050 | 0.914 | 3.050 | 0.000 | 1.030 | 4.340 | 0.000 | 0.000 |
| S1 | 0.000 | 1.150 | 0.896 | 0.000 | 0.000 | 0.936 | 0.000 | 16.100 | 0.000 |
| S3 | 0.000 | 0.802 | 1.140 | 0.000 | 0.000 | 1.080 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
protein domains:
|
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|
CL35 ----> CL93
No. of shared pairs: :516
CL35 ----> CL115
No. of shared pairs: :134
CL35 ----> CL179
No. of shared pairs: :85
CL35 ----> CL1
No. of shared pairs: :72
CL35 ----> CL76
No. of shared pairs: :28
CL35 ----> CL296
No. of shared pairs: :20