| size | 6857 |
| size_real | 6857 |
| ecount | 111895 |
| supercluster | 18 |
| annotations_summary | 0.04% organelle/plastid 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.489033659066232 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00320840017500365 |
| satellite_probability | 2.89707838193454e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 4 |
| S5 | 2310 |
| S4 | 2250 |
| S7 | 7 |
| S9 | 2 |
| S6 | 2270 |
| S2 | 6 |
| S1 | 3 |
| S3 | 6 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 23.0 | 28.0 | 0.5 | 0.5 | 24.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 23.0 | 12500.0 | 12500.0 | 66.5 | 62.5 | 12000.0 | 17.5 | 4.5 | 32.0 |
| S4 | 28.0 | 12500.0 | 12900.0 | 68.0 | 60.0 | 12200.0 | 15.0 | 8.5 | 37.0 |
| S7 | 0.5 | 66.5 | 68.0 | 0.0 | 1.0 | 64.5 | 0.0 | 0.0 | 0.5 |
| S9 | 0.5 | 62.5 | 60.0 | 1.0 | 1.0 | 47.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 24.0 | 12000.0 | 12200.0 | 64.5 | 47.5 | 11900.0 | 14.0 | 3.5 | 34.0 |
| S2 | 0.0 | 17.5 | 15.0 | 0.0 | 0.0 | 14.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 |
| S1 | 0.0 | 4.5 | 8.5 | 0.0 | 0.0 | 3.5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| S3 | 0.0 | 32.0 | 37.0 | 0.5 | 0.0 | 34.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 0.909 | 1.090 | 3.660 | 4.270 | 0.974 | 0.000 | 0.000 | 0.00 |
| S5 | 0.909 | 1.010 | 0.995 | 0.994 | 1.090 | 0.997 | 1.110 | 0.772 | 0.92 |
| S4 | 1.090 | 0.995 | 1.010 | 1.000 | 1.030 | 0.995 | 0.936 | 1.440 | 1.05 |
| S7 | 3.660 | 0.994 | 1.000 | 0.000 | 3.230 | 0.990 | 0.000 | 0.000 | 2.66 |
| S9 | 4.270 | 1.090 | 1.030 | 3.230 | 3.760 | 0.849 | 0.000 | 0.000 | 0.00 |
| S6 | 0.974 | 0.997 | 0.995 | 0.990 | 0.849 | 1.010 | 0.909 | 0.617 | 1.00 |
| S2 | 0.000 | 1.110 | 0.936 | 0.000 | 0.000 | 0.909 | 49.600 | 0.000 | 0.00 |
| S1 | 0.000 | 0.772 | 1.440 | 0.000 | 0.000 | 0.617 | 0.000 | 365.000 | 0.00 |
| S3 | 0.000 | 0.920 | 1.050 | 2.660 | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 10.20 |
protein domains:
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|
CL34 ----> CL13
No. of shared pairs: :37
CL34 ----> CL29
No. of shared pairs: :34
CL34 ----> CL396
No. of shared pairs: :21
CL34 ----> CL503
No. of shared pairs: :16
CL34 ----> CL19
No. of shared pairs: :15
CL34 ----> CL3
No. of shared pairs: :13
CL34 ----> CL82
No. of shared pairs: :13