| size | 7066 |
| size_real | 7066 |
| ecount | 92697 |
| supercluster | 8 |
| annotations_summary | 0.03% organelle/mitochondria 0.03% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.555702333773668 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000566091140673648 |
| satellite_probability | 1.29477276776204e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 38 |
| S5 | 5 |
| S4 | 14 |
| S7 | 44 |
| S9 | 45 |
| S6 | 6 |
| S2 | 2220 |
| S1 | 2340 |
| S3 | 2360 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 45.0 | 0.0 | 0.0 | 61.0 | 34.5 | 0.5 | 5.5 | 6.5 | 13.0 |
| S5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 16.0 | 15.0 | 16.5 |
| S4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 70.5 | 59.0 | 59.0 |
| S7 | 61.0 | 0.0 | 0.0 | 77.0 | 44.5 | 0.5 | 37.5 | 30.0 | 37.5 |
| S9 | 34.5 | 0.5 | 0.0 | 44.5 | 32.0 | 1.0 | 57.0 | 60.0 | 58.0 |
| S6 | 0.5 | 0.0 | 0.5 | 0.5 | 1.0 | 0.0 | 16.5 | 12.5 | 14.0 |
| S2 | 5.5 | 16.0 | 70.5 | 37.5 | 57.0 | 16.5 | 9940.0 | 9660.0 | 10600.0 |
| S1 | 6.5 | 15.0 | 59.0 | 30.0 | 60.0 | 12.5 | 9660.0 | 9620.0 | 10000.0 |
| S3 | 13.0 | 16.5 | 59.0 | 37.5 | 58.0 | 14.0 | 10600.0 | 10000.0 | 11000.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 151.000 | 0.000 | 0.000 | 118.000 | 67.000 | 6.140 | 0.101 | 0.123 | 0.228 |
| S5 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 3.360 | 0.000 | 1.020 | 0.981 | 1.000 |
| S4 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 5.390 | 1.140 | 0.980 | 0.911 |
| S7 | 118.000 | 0.000 | 0.000 | 86.100 | 49.800 | 3.540 | 0.397 | 0.327 | 0.380 |
| S9 | 67.000 | 3.360 | 0.000 | 49.800 | 35.900 | 7.090 | 0.605 | 0.655 | 0.588 |
| S6 | 6.140 | 0.000 | 5.390 | 3.540 | 7.090 | 0.000 | 1.110 | 0.863 | 0.898 |
| S2 | 0.101 | 1.020 | 1.140 | 0.397 | 0.605 | 1.110 | 0.999 | 0.999 | 1.010 |
| S1 | 0.123 | 0.981 | 0.980 | 0.327 | 0.655 | 0.863 | 0.999 | 1.020 | 0.993 |
| S3 | 0.228 | 1.000 | 0.911 | 0.380 | 0.588 | 0.898 | 1.010 | 0.993 | 1.010 |
protein domains:
|
|
||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL30 ----> CL7
No. of shared pairs: :395
CL30 ----> CL283
No. of shared pairs: :26
CL30 ----> CL170
No. of shared pairs: :21
CL30 ----> CL290
No. of shared pairs: :19
CL30 ----> CL171
No. of shared pairs: :17