| size | 7141 |
| size_real | 7141 |
| ecount | 193777 |
| supercluster | 17 |
| annotations_summary | 0.03% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.549359947927967 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000840218456798768 |
| satellite_probability | 1.46614129999921e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 4 |
| S5 | 2360 |
| S4 | 2370 |
| S7 | 9 |
| S9 | 2 |
| S6 | 2380 |
| S2 | 11 |
| S1 | 2 |
| S3 | 5 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 1.0 | 18 | 14.5 | 0.0 | 0 | 21.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 18.0 | 22100 | 22300.0 | 107.0 | 2 | 20700.0 | 81.0 | 32.0 | 20.0 |
| S4 | 14.5 | 22300 | 22800.0 | 116.0 | 1 | 20800.0 | 75.5 | 33.0 | 18.0 |
| S7 | 0.0 | 107 | 116.0 | 0.0 | 0 | 86.5 | 0.5 | 0.0 | 0.0 |
| S9 | 0.0 | 2 | 1.0 | 0.0 | 0 | 3.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 21.5 | 20700 | 20800.0 | 86.5 | 3 | 19700.0 | 59.5 | 36.0 | 21.0 |
| S2 | 0.0 | 81 | 75.5 | 0.5 | 0 | 59.5 | 2.0 | 0.0 | 0.0 |
| S1 | 0.0 | 32 | 33.0 | 0.0 | 0 | 36.0 | 0.0 | 0.0 | 0.5 |
| S3 | 0.0 | 20 | 18.0 | 0.0 | 0 | 21.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 64.100 | 0.970 | 0.772 | 0.00 | 0.000 | 1.230 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S5 | 0.970 | 1.000 | 0.998 | 1.02 | 0.988 | 0.998 | 1.100 | 0.934 | 0.996 |
| S4 | 0.772 | 0.998 | 1.010 | 1.10 | 0.488 | 0.990 | 1.010 | 0.952 | 0.886 |
| S7 | 0.000 | 1.020 | 1.100 | 0.00 | 0.000 | 0.880 | 1.430 | 0.000 | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 0.988 | 0.488 | 0.00 | 0.000 | 1.580 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S6 | 1.230 | 0.998 | 0.990 | 0.88 | 1.580 | 1.010 | 0.859 | 1.120 | 1.110 |
| S2 | 0.000 | 1.100 | 1.010 | 1.43 | 0.000 | 0.859 | 8.120 | 0.000 | 0.000 |
| S1 | 0.000 | 0.934 | 0.952 | 0.00 | 0.000 | 1.120 | 0.000 | 0.000 | 16.000 |
| S3 | 0.000 | 0.996 | 0.886 | 0.00 | 0.000 | 1.110 | 0.000 | 16.000 | 0.000 |
protein domains:
|
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|
CL29 ----> CL3
No. of shared pairs: :199
CL29 ----> CL101
No. of shared pairs: :45
CL29 ----> CL34
No. of shared pairs: :34
CL29 ----> CL230
No. of shared pairs: :34
CL29 ----> CL67
No. of shared pairs: :29
CL29 ----> CL19
No. of shared pairs: :25
CL29 ----> CL155
No. of shared pairs: :19
CL29 ----> CL1
No. of shared pairs: :11
CL29 ----> CL33
No. of shared pairs: :10
CL29 ----> CL169
No. of shared pairs: :10