| size | 7155 |
| size_real | 7155 |
| ecount | 61145 |
| supercluster | 16 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-GAG 0.01% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.551051376544548 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00139762403913347 |
| satellite_probability | 1.46614129999921e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 1 |
| S5 | 2440 |
| S4 | 2350 |
| S7 | 5 |
| S9 | 6 |
| S6 | 2340 |
| S2 | 5 |
| S1 | 4 |
| S3 | 2 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 0.0 | 7580.0 | 6920.0 | 13.5 | 22.0 | 6860.0 | 5.5 | 5.5 | 0.0 |
| S4 | 0.5 | 6920.0 | 6670.0 | 9.5 | 17.5 | 6370.0 | 3.5 | 4.5 | 0.5 |
| S7 | 0.0 | 13.5 | 9.5 | 0.0 | 0.0 | 12.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S9 | 0.0 | 22.0 | 17.5 | 0.0 | 0.0 | 16.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 0.0 | 6860.0 | 6370.0 | 12.5 | 16.5 | 6350.0 | 3.5 | 4.5 | 0.5 |
| S2 | 0.0 | 5.5 | 3.5 | 0.0 | 0.0 | 3.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S1 | 0.0 | 5.5 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S3 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 1.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.00 | 0.000 | 3.060 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.00e+00 |
| S5 | 0.00 | 1.010 | 0.988 | 1.090 | 1.120 | 0.999 | 1.260 | 1.080 | 0.00e+00 |
| S4 | 3.06 | 0.988 | 1.020 | 0.818 | 0.956 | 0.993 | 0.856 | 0.949 | 7.65e-01 |
| S7 | 0.00 | 1.090 | 0.818 | 0.000 | 0.000 | 1.100 | 0.000 | 0.000 | 0.00e+00 |
| S9 | 0.00 | 1.120 | 0.956 | 0.000 | 0.000 | 0.918 | 0.000 | 0.000 | 0.00e+00 |
| S6 | 0.00 | 0.999 | 0.993 | 1.100 | 0.918 | 1.010 | 0.873 | 0.967 | 7.79e-01 |
| S2 | 0.00 | 1.260 | 0.856 | 0.000 | 0.000 | 0.873 | 0.000 | 0.000 | 0.00e+00 |
| S1 | 0.00 | 1.080 | 0.949 | 0.000 | 0.000 | 0.967 | 0.000 | 0.000 | 0.00e+00 |
| S3 | 0.00 | 0.000 | 0.765 | 0.000 | 0.000 | 0.779 | 0.000 | 0.000 | 1.53e+04 |
protein domains:
|
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|
CL28 ----> CL146
No. of shared pairs: :124
CL28 ----> CL130
No. of shared pairs: :108
CL28 ----> CL43
No. of shared pairs: :79
CL28 ----> CL119
No. of shared pairs: :76
CL28 ----> CL71
No. of shared pairs: :60
CL28 ----> CL60
No. of shared pairs: :43