| size | 7202 |
| size_real | 7202 |
| ecount | 88000 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.04% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.590899050143583 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0895584559844488 |
| satellite_probability | 1.297386782619e-16 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 3 |
| S5 | 2420 |
| S4 | 2390 |
| S7 | 9 |
| S9 | 4 |
| S6 | 2360 |
| S2 | 7 |
| S1 | 3 |
| S3 | 2 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 7.0 | 6.0 | 0.0 | 0.0 | 8.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S5 | 7.0 | 9540.0 | 9680.0 | 21.5 | 5.5 | 9200.0 | 50.0 | 8.5 | 3 |
| S4 | 6.0 | 9680.0 | 10400.0 | 22.5 | 5.0 | 9990.0 | 50.5 | 3.5 | 6 |
| S7 | 0.0 | 21.5 | 22.5 | 1.0 | 0.0 | 26.0 | 0.0 | 0.5 | 0 |
| S9 | 0.0 | 5.5 | 5.0 | 0.0 | 1.0 | 10.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S6 | 8.5 | 9200.0 | 9990.0 | 26.0 | 10.0 | 9650.0 | 57.0 | 4.5 | 4 |
| S2 | 0.0 | 50.0 | 50.5 | 0.0 | 0.0 | 57.0 | 1.0 | 0.0 | 0 |
| S1 | 0.0 | 8.5 | 3.5 | 0.5 | 0.0 | 4.5 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S3 | 0.0 | 3.0 | 6.0 | 0.0 | 0.0 | 4.0 | 0.0 | 0.0 | 0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 1.000 | 0.813 | 0.000 | 0.000 | 1.200 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S5 | 1.000 | 1.030 | 0.989 | 0.928 | 0.789 | 0.981 | 0.973 | 1.540 | 0.712 |
| S4 | 0.813 | 0.989 | 1.010 | 0.917 | 0.677 | 1.000 | 0.928 | 0.600 | 1.340 |
| S7 | 0.000 | 0.928 | 0.917 | 17.200 | 0.000 | 1.110 | 0.000 | 36.200 | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 0.789 | 0.677 | 0.000 | 190.000 | 1.410 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S6 | 1.200 | 0.981 | 1.000 | 1.110 | 1.410 | 1.010 | 1.090 | 0.804 | 0.935 |
| S2 | 0.000 | 0.973 | 0.928 | 0.000 | 0.000 | 1.090 | 3.500 | 0.000 | 0.000 |
| S1 | 0.000 | 1.540 | 0.600 | 36.200 | 0.000 | 0.804 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S3 | 0.000 | 0.712 | 1.340 | 0.000 | 0.000 | 0.935 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
protein domains:
|
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|
CL26 ----> CL2
No. of shared pairs: :524
CL26 ----> CL44
No. of shared pairs: :78
CL26 ----> CL185
No. of shared pairs: :58
CL26 ----> CL82
No. of shared pairs: :57
CL26 ----> CL356
No. of shared pairs: :16
CL26 ----> CL3
No. of shared pairs: :12
CL26 ----> CL67
No. of shared pairs: :11
CL26 ----> CL684
No. of shared pairs: :11