| size | 7356 |
| size_real | 7356 |
| ecount | 279309 |
| supercluster | 15 |
| annotations_summary | 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH 0.01% Class_I/LINE:LINE-RT |
| pair_completeness | 0.52963194011229 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00135943447525829 |
| satellite_probability | 1.86264069827155e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 9 |
| S5 | 19 |
| S4 | 5 |
| S7 | 6 |
| S9 | 2 |
| S6 | 16 |
| S2 | 2360 |
| S1 | 2550 |
| S3 | 2380 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.5 | 0 | 0.0 | 85.5 | 97.0 | 84.0 |
| S5 | 1.0 | 5.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.5 | 83.0 | 84.0 | 83.0 |
| S4 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 16.5 | 15.5 | 16.5 |
| S7 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 56.5 | 61.5 | 63.5 |
| S9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 1.0 |
| S6 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0 | 2.0 | 50.5 | 46.0 | 53.5 |
| S2 | 85.5 | 83.0 | 16.5 | 56.5 | 0 | 50.5 | 29600.0 | 32600.0 | 28400.0 |
| S1 | 97.0 | 84.0 | 15.5 | 61.5 | 1 | 46.0 | 32600.0 | 36100.0 | 31400.0 |
| S3 | 84.0 | 83.0 | 16.5 | 63.5 | 1 | 53.5 | 28400.0 | 31400.0 | 27200.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 4.060 | 0.000 | 2.860 | 0.00 | 0.000 | 0.981 | 1.010 | 1.000 |
| S5 | 4.060 | 21.200 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 3.570 | 0.995 | 0.911 | 1.040 |
| S4 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 0.000 | 1.050 | 0.889 | 1.090 |
| S7 | 2.860 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 0.000 | 0.955 | 0.940 | 1.120 |
| S9 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 0.000 | 0.000 | 1.390 | 1.600 |
| S6 | 0.000 | 3.570 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 24.000 | 1.020 | 0.839 | 1.120 |
| S2 | 0.981 | 0.995 | 1.050 | 0.955 | 0.00 | 1.020 | 1.000 | 0.999 | 1.000 |
| S1 | 1.010 | 0.911 | 0.889 | 0.940 | 1.39 | 0.839 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S3 | 1.000 | 1.040 | 1.090 | 1.120 | 1.60 | 1.120 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
protein domains:
|
|
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|
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|
CL23 ----> CL152
No. of shared pairs: :161
CL23 ----> CL110
No. of shared pairs: :114
CL23 ----> CL148
No. of shared pairs: :73
CL23 ----> CL7
No. of shared pairs: :20
CL23 ----> CL284
No. of shared pairs: :20
CL23 ----> CL116
No. of shared pairs: :18
CL23 ----> CL327
No. of shared pairs: :16
CL23 ----> CL718
No. of shared pairs: :12
CL23 ----> CL42
No. of shared pairs: :11
CL23 ----> CL27
No. of shared pairs: :10