| size | 8662 |
| size_real | 8662 |
| ecount | 933026 |
| supercluster | 2 |
| annotations_summary | 0.02% organelle/mitochondria 0.02% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Galadriel:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.550107372942019 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0432220039292731 |
| satellite_probability | 4.10822619131233e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999991442257704 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 2850 |
| S5 | 26 |
| S4 | 13 |
| S7 | 2960 |
| S9 | 2760 |
| S6 | 9 |
| S2 | 19 |
| S1 | 13 |
| S3 | 8 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 98500 | 646.0 | 528.0 | 108000 | 94200 | 236.0 | 388.0 | 436.0 | 366.0 |
| S5 | 646 | 7.0 | 2.0 | 730 | 649 | 3.5 | 6.5 | 2.5 | 1.0 |
| S4 | 528 | 2.0 | 1.0 | 618 | 550 | 2.0 | 2.0 | 2.0 | 1.5 |
| S7 | 108000 | 730.0 | 618.0 | 118000 | 103000 | 250.0 | 440.0 | 464.0 | 377.0 |
| S9 | 94200 | 649.0 | 550.0 | 103000 | 90600 | 238.0 | 400.0 | 404.0 | 333.0 |
| S6 | 236 | 3.5 | 2.0 | 250 | 238 | 0.0 | 1.0 | 0.5 | 1.0 |
| S2 | 388 | 6.5 | 2.0 | 440 | 400 | 1.0 | 3.0 | 1.5 | 0.5 |
| S1 | 436 | 2.5 | 2.0 | 464 | 404 | 0.5 | 1.5 | 2.0 | 3.5 |
| S3 | 366 | 1.0 | 1.5 | 377 | 333 | 1.0 | 0.5 | 3.5 | 1.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 1.000 | 0.972 | 0.954 | 1.000 | 0.998 | 0.993 | 0.963 | 1.020 | 1.040 |
| S5 | 0.972 | 1.560 | 0.535 | 1.000 | 1.020 | 2.180 | 2.390 | 0.867 | 0.421 |
| S4 | 0.954 | 0.535 | 0.321 | 1.020 | 1.040 | 1.500 | 0.881 | 0.833 | 0.758 |
| S7 | 1.000 | 1.000 | 1.020 | 0.998 | 1.000 | 0.960 | 0.996 | 0.993 | 0.978 |
| S9 | 0.998 | 1.020 | 1.040 | 1.000 | 1.000 | 1.050 | 1.030 | 0.986 | 0.988 |
| S6 | 0.993 | 2.180 | 1.500 | 0.960 | 1.050 | 0.000 | 1.030 | 0.485 | 1.180 |
| S2 | 0.963 | 2.390 | 0.881 | 0.996 | 1.030 | 1.030 | 1.820 | 0.858 | 0.347 |
| S1 | 1.020 | 0.867 | 0.833 | 0.993 | 0.986 | 0.485 | 0.858 | 1.080 | 2.290 |
| S3 | 1.040 | 0.421 | 0.758 | 0.978 | 0.988 | 1.180 | 0.347 | 2.290 | 0.796 |
protein domains:
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