| size | 9271 |
| size_real | 9271 |
| ecount | 199828 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 4.63% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 2.83% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.04% organelle/plastid 0.01% Class_II/Subclass_2/Helitron:Helitron-HEL1 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.485261134251842 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000862905835400712 |
| satellite_probability | 2.89707838193454e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 3 |
| S5 | 3120 |
| S4 | 3020 |
| S7 | 7 |
| S9 | 5 |
| S6 | 3100 |
| S2 | 11 |
| S1 | 1 |
| S3 | 7 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 15.0 | 10.5 | 0.0 | 0.0 | 11.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S5 | 15.0 | 23800.0 | 21700.0 | 48.0 | 36.5 | 22900.0 | 132.0 | 1.5 | 25.0 |
| S4 | 10.5 | 21700.0 | 19900.0 | 42.5 | 33.0 | 21200.0 | 118.0 | 1.0 | 22.0 |
| S7 | 0.0 | 48.0 | 42.5 | 0.0 | 0.0 | 44.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S9 | 0.0 | 36.5 | 33.0 | 0.0 | 0.0 | 31.5 | 0.5 | 0.0 | 0.0 |
| S6 | 11.5 | 22900.0 | 21200.0 | 44.5 | 31.5 | 23200.0 | 128.0 | 0.5 | 18.5 |
| S2 | 0.0 | 132.0 | 118.0 | 0.0 | 0.5 | 128.0 | 0.0 | 0.0 | 0.5 |
| S1 | 0.0 | 1.5 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| S3 | 0.0 | 25.0 | 22.0 | 0.0 | 0.0 | 18.5 | 0.5 | 0.0 | 1.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 1.180 | 0.901 | 0.000 | 0.000 | 0.920 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S5 | 1.180 | 1.010 | 1.000 | 1.030 | 1.050 | 0.987 | 1.010 | 1.460 | 1.090 |
| S4 | 0.901 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.030 | 0.995 | 0.986 | 1.060 | 1.040 |
| S7 | 0.000 | 1.030 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.976 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 1.050 | 1.030 | 0.000 | 0.000 | 0.919 | 2.600 | 0.000 | 0.000 |
| S6 | 0.920 | 0.987 | 0.995 | 0.976 | 0.919 | 1.020 | 1.000 | 0.493 | 0.817 |
| S2 | 0.000 | 1.010 | 0.986 | 0.000 | 2.600 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 3.940 |
| S1 | 0.000 | 1.460 | 1.060 | 0.000 | 0.000 | 0.493 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| S3 | 0.000 | 1.090 | 1.040 | 0.000 | 0.000 | 0.817 | 3.940 | 0.000 | 44.500 |
protein domains:
|
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|
CL14 ----> CL13
No. of shared pairs: :400
CL14 ----> CL121
No. of shared pairs: :95
CL14 ----> CL155
No. of shared pairs: :35
CL14 ----> CL3
No. of shared pairs: :33
CL14 ----> CL1
No. of shared pairs: :12
CL14 ----> CL6
No. of shared pairs: :11
CL14 ----> CL16
No. of shared pairs: :11
CL14 ----> CL52
No. of shared pairs: :10