| size | 9282 |
| size_real | 9282 |
| ecount | 111952 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.65% organelle/mitochondria 0.15% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.505840363400389 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.139086403792286 |
| satellite_probability | 2.46412830486203e-14 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 1 |
| S5 | 3050 |
| S4 | 3030 |
| S7 | 8 |
| S9 | 8 |
| S6 | 3180 |
| S2 | 7 |
| S1 | 0 |
| S3 | 5 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0 | 0.0 | 1.5 | 0 | 0 | 0.0 |
| S5 | 0.5 | 11700.0 | 12200.0 | 41 | 33.5 | 12000.0 | 22 | 0 | 26.5 |
| S4 | 0.0 | 12200.0 | 12800.0 | 51 | 34.5 | 12800.0 | 19 | 0 | 19.5 |
| S7 | 0.0 | 41.0 | 51.0 | 1 | 0.0 | 48.0 | 0 | 0 | 0.0 |
| S9 | 0.0 | 33.5 | 34.5 | 0 | 0.0 | 35.0 | 0 | 0 | 0.0 |
| S6 | 1.5 | 12000.0 | 12800.0 | 48 | 35.0 | 12600.0 | 22 | 0 | 26.5 |
| S2 | 0.0 | 22.0 | 19.0 | 0 | 0.0 | 22.0 | 0 | 0 | 0.0 |
| S1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0.0 | 0.0 | 0 | 0 | 0.0 |
| S3 | 0.0 | 26.5 | 19.5 | 0 | 0.0 | 26.5 | 0 | 0 | 0.0 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 0.000 | 0.775 | 0.000 | 0.000 | 0.00 | 2.230 | 0.000 | NA | 0.000 |
| S5 | 0.775 | 1.010 | 0.997 | 0.902 | 1.01 | 0.994 | 1.080 | NA | 1.130 |
| S4 | 0.000 | 0.997 | 0.996 | 1.070 | 0.99 | 1.010 | 0.891 | NA | 0.795 |
| S7 | 0.000 | 0.902 | 1.070 | 5.630 | 0.00 | 1.010 | 0.000 | NA | 0.000 |
| S9 | 0.000 | 1.010 | 0.990 | 0.000 | 0.00 | 1.010 | 0.000 | NA | 0.000 |
| S6 | 2.230 | 0.994 | 1.010 | 1.010 | 1.01 | 0.998 | 1.040 | NA | 1.090 |
| S2 | 0.000 | 1.080 | 0.891 | 0.000 | 0.00 | 1.040 | 0.000 | NA | 0.000 |
| S1 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| S3 | 0.000 | 1.130 | 0.795 | 0.000 | 0.00 | 1.090 | 0.000 | NA | 0.000 |
protein domains:
|
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|
CL13 ----> CL3
No. of shared pairs: :501
CL13 ----> CL14
No. of shared pairs: :400
CL13 ----> CL6
No. of shared pairs: :249
CL13 ----> CL151
No. of shared pairs: :80
CL13 ----> CL39
No. of shared pairs: :78
CL13 ----> CL56
No. of shared pairs: :44
CL13 ----> CL90
No. of shared pairs: :40
CL13 ----> CL34
No. of shared pairs: :37
CL13 ----> CL184
No. of shared pairs: :29
CL13 ----> CL230
No. of shared pairs: :12
CL13 ----> CL503
No. of shared pairs: :12