| size | 11643 |
| size_real | 11643 |
| ecount | 237767 |
| supercluster | 8 |
| annotations_summary | 0.07% organelle/mitochondria 0.03% organelle/plastid 0.01% Class_I/LINE:LINE-RH |
| pair_completeness | 0.60393993663039 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0391651636176243 |
| satellite_probability | 2.61809967943218e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 66 |
| S5 | 8 |
| S4 | 13 |
| S7 | 54 |
| S9 | 64 |
| S6 | 26 |
| S2 | 3690 |
| S1 | 3890 |
| S3 | 3830 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 44.0 | 0.0 | 0.0 | 42 | 62.5 | 0.5 | 111.0 | 93.5 | 110 |
| S5 | 0.0 | 1.0 | 1.0 | 0 | 0.0 | 0.5 | 65.5 | 60.0 | 86 |
| S4 | 0.0 | 1.0 | 1.0 | 0 | 0.0 | 0.5 | 76.0 | 72.0 | 72 |
| S7 | 42.0 | 0.0 | 0.0 | 43 | 60.0 | 0.0 | 90.0 | 96.0 | 77 |
| S9 | 62.5 | 0.0 | 0.0 | 60 | 92.0 | 1.0 | 126.0 | 116.0 | 94 |
| S6 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 0 | 1.0 | 2.0 | 203.0 | 210.0 | 218 |
| S2 | 111.0 | 65.5 | 76.0 | 90 | 126.0 | 203.0 | 24500.0 | 25000.0 | 26100 |
| S1 | 93.5 | 60.0 | 72.0 | 96 | 116.0 | 210.0 | 25000.0 | 25800.0 | 26500 |
| S3 | 110.0 | 86.0 | 72.0 | 77 | 94.0 | 218.0 | 26100.0 | 26500.0 | 27800 |
| S8 | S5 | S4 | S7 | S9 | S6 | S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| S8 | 48.800 | 0.000 | 0.000 | 52.900 | 58.200 | 0.404 | 0.748 | 0.616 | 0.693 |
| S5 | 0.000 | 5.190 | 4.990 | 0.000 | 0.000 | 0.875 | 0.955 | 0.856 | 1.180 |
| S4 | 0.000 | 4.990 | 4.800 | 0.000 | 0.000 | 0.841 | 1.070 | 0.987 | 0.948 |
| S7 | 52.900 | 0.000 | 0.000 | 61.400 | 63.400 | 0.000 | 0.688 | 0.718 | 0.553 |
| S9 | 58.200 | 0.000 | 0.000 | 63.400 | 71.900 | 0.679 | 0.715 | 0.639 | 0.500 |
| S6 | 0.404 | 0.875 | 0.841 | 0.000 | 0.679 | 1.180 | 0.997 | 1.010 | 1.010 |
| S2 | 0.748 | 0.955 | 1.070 | 0.688 | 0.715 | 0.997 | 1.000 | 0.999 | 1.000 |
| S1 | 0.616 | 0.856 | 0.987 | 0.718 | 0.639 | 1.010 | 0.999 | 1.010 | 0.998 |
| S3 | 0.693 | 1.180 | 0.948 | 0.553 | 0.500 | 1.010 | 1.000 | 0.998 | 1.010 |
protein domains:
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL7 ----> CL30
No. of shared pairs: :395
CL7 ----> CL125
No. of shared pairs: :318
CL7 ----> CL96
No. of shared pairs: :59
CL7 ----> CL283
No. of shared pairs: :39
CL7 ----> CL170
No. of shared pairs: :35
CL7 ----> CL235
No. of shared pairs: :27
CL7 ----> CL110
No. of shared pairs: :26
CL7 ----> CL23
No. of shared pairs: :20
CL7 ----> CL64
No. of shared pairs: :19
CL7 ----> CL290
No. of shared pairs: :19
CL7 ----> CL85
No. of shared pairs: :11
CL7 ----> CL1452
No. of shared pairs: :11
CL7 ----> CL485
No. of shared pairs: :10