| size | 2290 |
| size_real | 2290 |
| ecount | 112211 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/nonchromo-outgroup:Ty3-GAG |
| pair_completeness | 0.20844327176781 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00262008733624454 |
| satellite_probability | 1.5718759856987e-20 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 757 |
| S9 | 778 |
| S7 | 755 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 12600 | 12400 | 12600 |
| S9 | 12400 | 12100 | 12400 |
| S7 | 12600 | 12400 | 12500 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 0.997 | 1.000 | 1.000 |
| S9 | 1.000 | 0.994 | 1.010 |
| S7 | 1.000 | 1.010 | 0.992 |
protein domains:
|
|
||||||
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL59 ----> CL4
No. of shared pairs: :502
CL59 ----> CL63
No. of shared pairs: :165
CL59 ----> CL13
No. of shared pairs: :67
CL59 ----> CL83
No. of shared pairs: :24
CL59 ----> CL31
No. of shared pairs: :19