| size | 5673 |
| size_real | 5673 |
| ecount | 192311 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 0.14% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.02% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tcn1:Ty3-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.630640988789882 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00264410364886304 |
| satellite_probability | 4.97759293480724e-22 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 1860 |
| S9 | 1890 |
| S7 | 1920 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 20100 | 20400 | 21600 |
| S9 | 20400 | 20700 | 22000 |
| S7 | 21600 | 22000 | 23500 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 1.000 | 1.000 | 0.997 |
| S9 | 1.000 | 1.000 | 0.999 |
| S7 | 0.997 | 0.999 | 1.000 |
protein domains:
|
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|
CL36 ----> CL44
No. of shared pairs: :218
CL36 ----> CL21
No. of shared pairs: :153
CL36 ----> CL1
No. of shared pairs: :12