| size | 5808 |
| size_real | 5808 |
| ecount | 709039 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-I:Ty1-INT 0.02% organelle/mitochondria 0.02% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-INT 0.02% Class_I/LINE:LINE-RT |
| pair_completeness | 0.316409791477788 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0275482093663912 |
| satellite_probability | 5.62197268654316e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 1890 |
| S9 | 1900 |
| S7 | 2020 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 75800 | 76500 | 79600 |
| S9 | 76500 | 77100 | 80100 |
| S7 | 79600 | 80100 | 83700 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S9 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
| S7 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL32 ----> CL11
No. of shared pairs: :1265
CL32 ----> CL49
No. of shared pairs: :666
CL32 ----> CL72
No. of shared pairs: :249
CL32 ----> CL93
No. of shared pairs: :45
CL32 ----> CL26
No. of shared pairs: :40
CL32 ----> CL31
No. of shared pairs: :16