| size | 6106 |
| size_real | 6106 |
| ecount | 103740 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.44% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RH |
| pair_completeness | 0.418350754936121 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00114641336390436 |
| satellite_probability | 5.57078696969618e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 2060 |
| S9 | 2010 |
| S7 | 2040 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 11900 | 11400 | 11800 |
| S9 | 11400 | 11000 | 11400 |
| S7 | 11800 | 11400 | 11700 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 1.000 | 0.995 | 1.000 |
| S9 | 0.995 | 1.000 | 1.000 |
| S7 | 1.000 | 1.000 | 0.996 |
protein domains:
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|
CL29 ----> CL2
No. of shared pairs: :935
CL29 ----> CL18
No. of shared pairs: :93
CL29 ----> CL40
No. of shared pairs: :67
CL29 ----> CL61
No. of shared pairs: :50
CL29 ----> CL8
No. of shared pairs: :32
CL29 ----> CL27
No. of shared pairs: :23
CL29 ----> CL175
No. of shared pairs: :19
CL29 ----> CL16
No. of shared pairs: :16
CL29 ----> CL13
No. of shared pairs: :13
CL29 ----> CL22
No. of shared pairs: :12