| size | 6669 |
| size_real | 6669 |
| ecount | 315188 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 0.07% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-GAG 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RH 0.03% Class_I/LINE:LINE-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-GAG 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/hAT:hAT-TPase 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.672686230248307 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00974658869395711 |
| satellite_probability | 1.9456658316349e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 2170 |
| S9 | 2310 |
| S7 | 2190 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 34400 | 36700 | 33200 |
| S9 | 36700 | 39100 | 35100 |
| S7 | 33200 | 35100 | 31600 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 0.996 | 1.000 | 1.000 |
| S9 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
| S7 | 1.000 | 0.998 | 0.998 |
protein domains:
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|
CL21 ----> CL33
No. of shared pairs: :222
CL21 ----> CL36
No. of shared pairs: :153
CL21 ----> CL10
No. of shared pairs: :28
CL21 ----> CL2
No. of shared pairs: :16
CL21 ----> CL44
No. of shared pairs: :14
CL21 ----> CL1
No. of shared pairs: :12
CL21 ----> CL6
No. of shared pairs: :10