| size | 7137 |
| size_real | 7137 |
| ecount | 229219 |
| supercluster | 8 |
| annotations_summary | 0.07% organelle/plastid 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-GAG |
| pair_completeness | 0.569951605807303 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000840689365279529 |
| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 2360 |
| S9 | 2430 |
| S7 | 2350 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 24500 | 25200 | 25200 |
| S9 | 25200 | 26100 | 25900 |
| S7 | 25200 | 25900 | 25900 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 1 | 1.000 | 1.000 |
| S9 | 1 | 1.000 | 0.998 |
| S7 | 1 | 0.998 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL18 ----> CL61
No. of shared pairs: :116
CL18 ----> CL29
No. of shared pairs: :93
CL18 ----> CL8
No. of shared pairs: :88
CL18 ----> CL13
No. of shared pairs: :14
CL18 ----> CL2
No. of shared pairs: :11
CL18 ----> CL27
No. of shared pairs: :10
CL18 ----> CL40
No. of shared pairs: :10
CL18 ----> CL193
No. of shared pairs: :10