| size | 7715 |
| size_real | 7715 |
| ecount | 53189 |
| supercluster | 7 |
| annotations_summary | 0.03% Class_I/LINE:LINE-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RT 0.01% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Alesia:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tcn1:Ty3-GAG 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/MuDR_Mutator:MuDR-TPase |
| pair_completeness | 0.568408213051433 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00414776409591705 |
| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S8 | 2630 |
| S9 | 2570 |
| S7 | 2510 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 5780 | 5870 | 5780 |
| S9 | 5870 | 6110 | 6020 |
| S7 | 5780 | 6020 | 5930 |
| S8 | S9 | S7 | |
|---|---|---|---|
| S8 | 1.010 | 0.995 | 0.994 |
| S9 | 0.995 | 1.000 | 1.000 |
| S7 | 0.994 | 1.000 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL15 ----> CL22
No. of shared pairs: :190
CL15 ----> CL17
No. of shared pairs: :76
CL15 ----> CL80
No. of shared pairs: :72
CL15 ----> CL1
No. of shared pairs: :58
CL15 ----> CL90
No. of shared pairs: :23
CL15 ----> CL30
No. of shared pairs: :21
CL15 ----> CL7
No. of shared pairs: :20
CL15 ----> CL41
No. of shared pairs: :19
CL15 ----> CL75
No. of shared pairs: :19
CL15 ----> CL16
No. of shared pairs: :17
CL15 ----> CL187
No. of shared pairs: :15
CL15 ----> CL28
No. of shared pairs: :14
CL15 ----> CL26
No. of shared pairs: :10
CL15 ----> CL62
No. of shared pairs: :10
CL15 ----> CL408
No. of shared pairs: :10