| size | 2841 |
| size_real | 2841 |
| ecount | 141458 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tcn1:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.402962962962963 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0570221752903907 |
| satellite_probability | 9.38962016163371e-18 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 928 |
| S4 | 976 |
| S6 | 937 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 15800 | 15800 | 15800 |
| S4 | 15800 | 15800 | 15700 |
| S6 | 15800 | 15700 | 15400 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 0.995 | 1.000 | 1.000 |
| S4 | 1.000 | 0.999 | 1.000 |
| S6 | 1.000 | 1.000 | 0.994 |
protein domains:
|
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CL109 ----> CL23
No. of shared pairs: :487
CL109 ----> CL46
No. of shared pairs: :85
CL109 ----> CL129
No. of shared pairs: :39
CL109 ----> CL29
No. of shared pairs: :21
CL109 ----> CL71
No. of shared pairs: :21