| size | 3378 |
| size_real | 3378 |
| ecount | 13073 |
| supercluster | 33 |
| annotations_summary | 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Bianca:Ty1-INT 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIII:Ty3-RH 0.03% organelle/plastid 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tcn1:Ty3-INT |
| pair_completeness | 0.383292383292383 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00710900473933649 |
| satellite_probability | 1.1303462298218e-20 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999923582454532 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1110 |
| S4 | 1130 |
| S6 | 1140 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1460 | 1440 | 1410 |
| S4 | 1440 | 1490 | 1490 |
| S6 | 1410 | 1490 | 1450 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.030 | 0.988 | 0.984 |
| S4 | 0.988 | 0.997 | 1.010 |
| S6 | 0.984 | 1.010 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL98 ----> CL13
No. of shared pairs: :109
CL98 ----> CL77
No. of shared pairs: :72
CL98 ----> CL2
No. of shared pairs: :69
CL98 ----> CL30
No. of shared pairs: :30
CL98 ----> CL84
No. of shared pairs: :24
CL98 ----> CL50
No. of shared pairs: :23
CL98 ----> CL134
No. of shared pairs: :18
CL98 ----> CL67
No. of shared pairs: :14
CL98 ----> CL48
No. of shared pairs: :11