| size | 3579 |
| size_real | 3579 |
| ecount | 21089 |
| supercluster | 10 |
| annotations_summary | 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-GAG 0.03% Class_I/LINE:LINE-RT |
| pair_completeness | 0.571805006587615 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00558815311539536 |
| satellite_probability | 4.79804177716536e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1270 |
| S4 | 1180 |
| S6 | 1130 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 2720 | 2480 | 2300 |
| S4 | 2480 | 2370 | 2210 |
| S6 | 2300 | 2210 | 2020 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.020 | 0.986 | 0.992 |
| S4 | 0.986 | 1.000 | 1.010 |
| S6 | 0.992 | 1.010 | 0.998 |
protein domains:
|
|
||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL90 ----> CL62
No. of shared pairs: :109
CL90 ----> CL34
No. of shared pairs: :75
CL90 ----> CL141
No. of shared pairs: :18