| size | 4023 |
| size_real | 4023 |
| ecount | 64869 |
| supercluster | 27 |
| annotations_summary | 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Angela:Ty1-RT 0.02% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase 0.02% Class_I/LINE:LINE-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.296069587628866 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000745712155108128 |
| satellite_probability | 1.1968150618018e-20 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1330 |
| S4 | 1330 |
| S6 | 1370 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 6740 | 7220 | 6830 |
| S4 | 7220 | 7920 | 7480 |
| S6 | 6830 | 7480 | 7140 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.996 | 0.993 |
| S4 | 0.996 | 1.000 | 1.000 |
| S6 | 0.993 | 1.000 | 1.010 |
protein domains:
|
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|
CL83 ----> CL69
No. of shared pairs: :149
CL83 ----> CL28
No. of shared pairs: :57
CL83 ----> CL86
No. of shared pairs: :43
CL83 ----> CL114
No. of shared pairs: :17
CL83 ----> CL15
No. of shared pairs: :13