| size | 4096 |
| size_real | 4096 |
| ecount | 38565 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 1.93% organelle/mitochondria 0.15% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIII:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT |
| pair_completeness | 0.367156208277704 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.1787109375 |
| satellite_probability | 7.84969840308267e-13 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1360 |
| S4 | 1380 |
| S6 | 1360 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 4430 | 4250 | 4270 |
| S4 | 4250 | 4310 | 4250 |
| S6 | 4270 | 4250 | 4280 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.020 | 0.988 | 0.993 |
| S4 | 0.988 | 1.010 | 1.000 |
| S6 | 0.993 | 1.000 | 1.010 |
protein domains:
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CL81 ----> CL2
No. of shared pairs: :559
CL81 ----> CL77
No. of shared pairs: :108
CL81 ----> CL104
No. of shared pairs: :80
CL81 ----> CL49
No. of shared pairs: :56
CL81 ----> CL10
No. of shared pairs: :13
CL81 ----> CL182
No. of shared pairs: :11