| size | 4379 |
| size_real | 4379 |
| ecount | 54569 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-aRH 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-RH 0.02% Class_I/LINE:LINE-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.621851851851852 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.221740123315826 |
| satellite_probability | 2.87229364957616e-12 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1430 |
| S4 | 1400 |
| S6 | 1540 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 6030 | 5690 | 6300 |
| S4 | 5690 | 5580 | 6130 |
| S6 | 6300 | 6130 | 6710 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.99 | 0.997 |
| S4 | 0.990 | 1.01 | 1.000 |
| S6 | 0.997 | 1.00 | 0.999 |
protein domains:
|
|
||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL75 ----> CL53
No. of shared pairs: :194
CL75 ----> CL187
No. of shared pairs: :17
CL75 ----> CL191
No. of shared pairs: :15
CL75 ----> CL25
No. of shared pairs: :11
CL75 ----> CL164
No. of shared pairs: :10