| size | 4624 |
| size_real | 4624 |
| ecount | 18765 |
| supercluster | 11 |
| annotations_summary | 0.04% Class_II/Subclass_2/Helitron:Helitron-HEL1 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/Phygy:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-PROT |
| pair_completeness | 0.39993944898577 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000216262975778547 |
| satellite_probability | 6.52979343237575e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1490 |
| S4 | 1640 |
| S6 | 1500 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 2150 | 2100 | 2010 |
| S4 | 2100 | 2270 | 2060 |
| S6 | 2010 | 2060 | 2010 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.030 | 0.980 | 0.991 |
| S4 | 0.980 | 1.030 | 0.987 |
| S6 | 0.991 | 0.987 | 1.020 |
protein domains:
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|
CL72 ----> CL20
No. of shared pairs: :272
CL72 ----> CL41
No. of shared pairs: :191
CL72 ----> CL65
No. of shared pairs: :59
CL72 ----> CL339
No. of shared pairs: :14
CL72 ----> CL59
No. of shared pairs: :11
CL72 ----> CL278
No. of shared pairs: :11
CL72 ----> CL229
No. of shared pairs: :10