| size | 4829 |
| size_real | 4829 |
| ecount | 205918 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.02% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.362200282087447 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0372747980948437 |
| satellite_probability | 1.12309779384282e-18 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1570 |
| S4 | 1630 |
| S6 | 1620 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 20200 | 22800 | 21500 |
| S4 | 22800 | 25800 | 24200 |
| S6 | 21500 | 24200 | 22900 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S4 | 1.000 | 1.000 | 0.996 |
| S6 | 1.000 | 0.996 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL68 ----> CL43
No. of shared pairs: :744
CL68 ----> CL17
No. of shared pairs: :209
CL68 ----> CL196
No. of shared pairs: :19
CL68 ----> CL115
No. of shared pairs: :14
CL68 ----> CL274
No. of shared pairs: :13