| size | 5725 |
| size_real | 5725 |
| ecount | 764171 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.03% Class_II/Subclass_2/Helitron:Helitron-HEL2 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH |
| pair_completeness | 0.428393213572854 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00925764192139738 |
| satellite_probability | 1.0041894271145e-20 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1890 |
| S4 | 1930 |
| S6 | 1910 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 81500 | 84400 | 83500 |
| S4 | 84400 | 87300 | 86700 |
| S6 | 83500 | 86700 | 86200 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
| S4 | 1.000 | 0.999 | 1.000 |
| S6 | 0.998 | 1.000 | 1.000 |
protein domains:
|
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|
CL56 ----> CL11
No. of shared pairs: :920
CL56 ----> CL104
No. of shared pairs: :460
CL56 ----> CL153
No. of shared pairs: :94
CL56 ----> CL8
No. of shared pairs: :21