| size | 5925 |
| size_real | 5925 |
| ecount | 142397 |
| supercluster | 5 |
| annotations_summary | 0.03% Class_II/Subclass_1/TIR/PIF_Harbinger:Harbinger-TPase 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.493195564516129 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000844594594594595 |
| satellite_probability | 2.89707838193454e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999971938882887 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 1980 |
| S4 | 1920 |
| S6 | 2030 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 15500 | 15100 | 16300 |
| S4 | 15100 | 14900 | 16100 |
| S6 | 16300 | 16100 | 17200 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.996 | 0.999 |
| S4 | 0.996 | 0.999 | 1.010 |
| S6 | 0.999 | 1.010 | 0.996 |
protein domains:
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|
CL54 ----> CL37
No. of shared pairs: :608
CL54 ----> CL16
No. of shared pairs: :198
CL54 ----> CL150
No. of shared pairs: :57
CL54 ----> CL104
No. of shared pairs: :41
CL54 ----> CL199
No. of shared pairs: :39
CL54 ----> CL205
No. of shared pairs: :20
CL54 ----> CL193
No. of shared pairs: :16
CL54 ----> CL306
No. of shared pairs: :13
CL54 ----> CL2
No. of shared pairs: :10