| size | 5945 |
| size_real | 5945 |
| ecount | 884116 |
| supercluster | 6 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Galadriel:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RH |
| pair_completeness | 0.566947812335266 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00285954583683768 |
| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2020 |
| S4 | 1950 |
| S6 | 1980 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 99500 | 98000 | 99300 |
| S4 | 98000 | 96700 | 97500 |
| S6 | 99300 | 97500 | 98300 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 0.999 | 0.999 | 1.000 |
| S4 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S6 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
protein domains:
|
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|
CL52 ----> CL78
No. of shared pairs: :415
CL52 ----> CL66
No. of shared pairs: :365
CL52 ----> CL125
No. of shared pairs: :188
CL52 ----> CL20
No. of shared pairs: :19