| size | 6103 |
| size_real | 6103 |
| ecount | 226679 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-RT 0.02% Class_II/Subclass_1/TIR/hAT:hAT-TPase 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.459000717188621 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.026872030149107 |
| satellite_probability | 3.2152786552126e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2040 |
| S4 | 1980 |
| S6 | 2080 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 24700 | 24300 | 25700 |
| S4 | 24300 | 24300 | 25500 |
| S6 | 25700 | 25500 | 26600 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 0.996 | 1.000 |
| S4 | 0.996 | 1.000 | 1.000 |
| S6 | 1.000 | 1.000 | 0.997 |
protein domains:
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|
CL49 ----> CL104
No. of shared pairs: :213
CL49 ----> CL182
No. of shared pairs: :99
CL49 ----> CL81
No. of shared pairs: :56
CL49 ----> CL2
No. of shared pairs: :28
CL49 ----> CL77
No. of shared pairs: :26
CL49 ----> CL225
No. of shared pairs: :22
CL49 ----> CL264
No. of shared pairs: :22
CL49 ----> CL342
No. of shared pairs: :16
CL49 ----> CL1
No. of shared pairs: :11