| size | 6252 |
| size_real | 6252 |
| ecount | 631796 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LINE:LINE-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RT 0.02% Class_I/LINE:LINE-ENDO 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-GAG |
| pair_completeness | 0.439226519337017 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.167626359564939 |
| satellite_probability | 4.09756835003286e-13 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2000 |
| S4 | 2080 |
| S6 | 2170 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 70700 | 69000 | 71900 |
| S4 | 69000 | 67200 | 69900 |
| S6 | 71900 | 69900 | 72500 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 0.999 | 1 | 1.000 |
| S4 | 1.000 | 1 | 1.000 |
| S6 | 1.000 | 1 | 0.998 |
protein domains:
|
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|
CL46 ----> CL23
No. of shared pairs: :892
CL46 ----> CL99
No. of shared pairs: :402
CL46 ----> CL71
No. of shared pairs: :139
CL46 ----> CL109
No. of shared pairs: :85
CL46 ----> CL55
No. of shared pairs: :58
CL46 ----> CL29
No. of shared pairs: :20
CL46 ----> CL134
No. of shared pairs: :10