| size | 6381 |
| size_real | 6381 |
| ecount | 72579 |
| supercluster | 9 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.491584852734923 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000783576241968343 |
| satellite_probability | 2.89707838193454e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2060 |
| S4 | 2160 |
| S6 | 2160 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 7640 | 7850 | 7950 |
| S4 | 7850 | 8520 | 8250 |
| S6 | 7950 | 8250 | 8320 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.988 | 1.000 |
| S4 | 0.988 | 1.020 | 0.992 |
| S6 | 1.000 | 0.992 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL41 ----> CL65
No. of shared pairs: :201
CL41 ----> CL72
No. of shared pairs: :191
CL41 ----> CL69
No. of shared pairs: :123
CL41 ----> CL20
No. of shared pairs: :53
CL41 ----> CL113
No. of shared pairs: :53
CL41 ----> CL76
No. of shared pairs: :30
CL41 ----> CL59
No. of shared pairs: :29
CL41 ----> CL15
No. of shared pairs: :15