| size | 7480 |
| size_real | 7480 |
| ecount | 1022876 |
| supercluster | 2 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.03% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-GAG 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.478553073729986 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00160427807486631 |
| satellite_probability | 3.21043016719236e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2550 |
| S4 | 2370 |
| S6 | 2560 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 122000 | 111000 | 120000 |
| S4 | 111000 | 102000 | 109000 |
| S6 | 120000 | 109000 | 118000 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S4 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
| S6 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL32 ----> CL102
No. of shared pairs: :491
CL32 ----> CL48
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CL32 ----> CL13
No. of shared pairs: :50
CL32 ----> CL18
No. of shared pairs: :49
CL32 ----> CL259
No. of shared pairs: :33
CL32 ----> CL333
No. of shared pairs: :17
CL32 ----> CL5
No. of shared pairs: :15
CL32 ----> CL6
No. of shared pairs: :15
CL32 ----> CL12
No. of shared pairs: :15
CL32 ----> CL2
No. of shared pairs: :14
CL32 ----> CL386
No. of shared pairs: :13
CL32 ----> CL1
No. of shared pairs: :11
CL32 ----> CL3
No. of shared pairs: :11
CL32 ----> CL430
No. of shared pairs: :11
CL32 ----> CL26
No. of shared pairs: :10
CL32 ----> CL400
No. of shared pairs: :10