| size | 8106 |
| size_real | 8106 |
| ecount | 251979 |
| supercluster | 12 |
| annotations_summary | 0.05% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.01% Class_I/LINE:LINE-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.430134086097389 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000616827041697508 |
| satellite_probability | 5.12148319141113e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 2700 |
| S4 | 2720 |
| S6 | 2680 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 28000 | 28100 | 27800 |
| S4 | 28100 | 28100 | 28000 |
| S6 | 27800 | 28000 | 28100 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 1.000 | 0.994 |
| S4 | 1.000 | 0.999 | 0.999 |
| S6 | 0.994 | 0.999 | 1.010 |
protein domains:
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|
CL30 ----> CL77
No. of shared pairs: :305
CL30 ----> CL98
No. of shared pairs: :30
CL30 ----> CL10
No. of shared pairs: :17
CL30 ----> CL5
No. of shared pairs: :15
CL30 ----> CL1
No. of shared pairs: :13
CL30 ----> CL13
No. of shared pairs: :12
CL30 ----> CL4
No. of shared pairs: :10
CL30 ----> CL20
No. of shared pairs: :10