| size | 10455 |
| size_real | 10455 |
| ecount | 304513 |
| supercluster | 5 |
| annotations_summary | 0.26% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-PROT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-PROT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.01% Class_I/LINE:LINE-ENDO |
| pair_completeness | 0.661897949451598 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0156862745098039 |
| satellite_probability | 2.51712823533368e-20 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 3560 |
| S4 | 3440 |
| S6 | 3460 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 36500 | 34200 | 34700 |
| S4 | 34200 | 32300 | 32500 |
| S6 | 34700 | 32500 | 33000 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
| S4 | 0.998 | 1.000 | 0.998 |
| S6 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL16 ----> CL93
No. of shared pairs: :229
CL16 ----> CL54
No. of shared pairs: :198
CL16 ----> CL139
No. of shared pairs: :70
CL16 ----> CL137
No. of shared pairs: :46
CL16 ----> CL104
No. of shared pairs: :37
CL16 ----> CL175
No. of shared pairs: :33
CL16 ----> CL217
No. of shared pairs: :26
CL16 ----> CL37
No. of shared pairs: :13
CL16 ----> CL250
No. of shared pairs: :13