| size | 10590 |
| size_real | 10590 |
| ecount | 540670 |
| supercluster | 8 |
| annotations_summary | 0.05% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-RT |
| pair_completeness | 0.641860465116279 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.18847969782814 |
| satellite_probability | 1.84812477033038e-13 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 3540 |
| S4 | 3580 |
| S6 | 3480 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 62800 | 61300 | 59900 |
| S4 | 61300 | 60300 | 58800 |
| S6 | 59900 | 58800 | 57700 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 0.998 | 0.998 |
| S4 | 0.998 | 1.000 | 0.999 |
| S6 | 0.998 | 0.999 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL14 ----> CL51
No. of shared pairs: :518
CL14 ----> CL120
No. of shared pairs: :313
CL14 ----> CL133
No. of shared pairs: :127
CL14 ----> CL119
No. of shared pairs: :72
CL14 ----> CL71
No. of shared pairs: :65
CL14 ----> CL50
No. of shared pairs: :18
CL14 ----> CL220
No. of shared pairs: :15
CL14 ----> CL301
No. of shared pairs: :15
CL14 ----> CL363
No. of shared pairs: :14
CL14 ----> CL364
No. of shared pairs: :13
CL14 ----> CL5
No. of shared pairs: :12