| size | 10691 |
| size_real | 10691 |
| ecount | 465979 |
| supercluster | 16 |
| annotations_summary | 0.05% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-INT 0.01% Class_I/LINE:LINE-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-GAG 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.574985268120212 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000841829576279113 |
| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 3550 |
| S4 | 3580 |
| S6 | 3560 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 54200 | 53300 | 51000 |
| S4 | 53300 | 53000 | 50700 |
| S6 | 51000 | 50700 | 48800 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.998 | 0.995 |
| S4 | 0.998 | 1.000 | 0.999 |
| S6 | 0.995 | 0.999 | 1.010 |
protein domains:
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|
CL13 ----> CL48
No. of shared pairs: :219
CL13 ----> CL7
No. of shared pairs: :139
CL13 ----> CL98
No. of shared pairs: :109
CL13 ----> CL67
No. of shared pairs: :56
CL13 ----> CL32
No. of shared pairs: :50
CL13 ----> CL1
No. of shared pairs: :20
CL13 ----> CL5
No. of shared pairs: :19
CL13 ----> CL4
No. of shared pairs: :18
CL13 ----> CL63
No. of shared pairs: :17
CL13 ----> CL12
No. of shared pairs: :13
CL13 ----> CL2
No. of shared pairs: :12
CL13 ----> CL30
No. of shared pairs: :12
CL13 ----> CL77
No. of shared pairs: :12
CL13 ----> CL24
No. of shared pairs: :11
CL13 ----> CL3
No. of shared pairs: :10
CL13 ----> CL17
No. of shared pairs: :10