| size | 11717 |
| size_real | 11717 |
| ecount | 445928 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.19% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.01% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-INT 0.01% Class_II/Subclass_2/Helitron:Helitron-HEL2 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-INT |
| pair_completeness | 0.448868554470137 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0163011009644107 |
| satellite_probability | 1.80035564743697e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 4060 |
| S4 | 3790 |
| S6 | 3870 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 54600 | 49500 | 51700 |
| S4 | 49500 | 45400 | 47200 |
| S6 | 51700 | 47200 | 49100 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.000 | 0.998 | 0.999 |
| S4 | 0.998 | 1.000 | 1.000 |
| S6 | 0.999 | 1.000 | 0.999 |
protein domains:
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CL10 ----> CL2
No. of shared pairs: :681
CL10 ----> CL27
No. of shared pairs: :304
CL10 ----> CL1
No. of shared pairs: :23
CL10 ----> CL30
No. of shared pairs: :17
CL10 ----> CL33
No. of shared pairs: :15
CL10 ----> CL57
No. of shared pairs: :15
CL10 ----> CL9
No. of shared pairs: :14
CL10 ----> CL81
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CL10 ----> CL137
No. of shared pairs: :13
CL10 ----> CL20
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CL10 ----> CL4
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CL10 ----> CL22
No. of shared pairs: :10
CL10 ----> CL26
No. of shared pairs: :10
CL10 ----> CL39
No. of shared pairs: :10