| size | 13849 |
| size_real | 13849 |
| ecount | 355214 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.15% organelle/plastid 0.09% organelle/mitochondria 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/hAT:hAT-TPase 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/CRM:Ty3-GAG 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.515539505362224 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.026648371488409 |
| satellite_probability | 2.1381336150938e-19 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 0.999997185263164 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S5 | 4710 |
| S4 | 4660 |
| S6 | 4480 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 40500 | 40600 | 38400 |
| S4 | 40600 | 41600 | 39100 |
| S6 | 38400 | 39100 | 36900 |
| S5 | S4 | S6 | |
|---|---|---|---|
| S5 | 1.010 | 0.994 | 0.998 |
| S4 | 0.994 | 1.000 | 1.000 |
| S6 | 0.998 | 1.000 | 1.000 |
protein domains:
|
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|
CL5 ----> CL4
No. of shared pairs: :1052
CL5 ----> CL50
No. of shared pairs: :540
CL5 ----> CL119
No. of shared pairs: :179
CL5 ----> CL6
No. of shared pairs: :172
CL5 ----> CL51
No. of shared pairs: :160
CL5 ----> CL180
No. of shared pairs: :73
CL5 ----> CL77
No. of shared pairs: :59
CL5 ----> CL31
No. of shared pairs: :52
CL5 ----> CL140
No. of shared pairs: :39
CL5 ----> CL21
No. of shared pairs: :31
CL5 ----> CL64
No. of shared pairs: :29
CL5 ----> CL2
No. of shared pairs: :22
CL5 ----> CL7
No. of shared pairs: :19
CL5 ----> CL13
No. of shared pairs: :19
CL5 ----> CL19
No. of shared pairs: :18
CL5 ----> CL117
No. of shared pairs: :16
CL5 ----> CL1
No. of shared pairs: :15
CL5 ----> CL30
No. of shared pairs: :15
CL5 ----> CL32
No. of shared pairs: :15
CL5 ----> CL47
No. of shared pairs: :13
CL5 ----> CL14
No. of shared pairs: :12
CL5 ----> CL556
No. of shared pairs: :12