| size | 4528 |
| size_real | 4528 |
| ecount | 37479 |
| supercluster | 5 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-PROT |
| pair_completeness | 0.777777777777778 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000220848056537102 |
| satellite_probability | 3.89552186042479e-23 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 1450 |
| S1 | 1560 |
| S3 | 1520 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 4050 | 4140 | 4030 |
| S1 | 4140 | 4320 | 4330 |
| S3 | 4030 | 4330 | 4100 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.020 | 0.992 | 0.992 |
| S1 | 0.992 | 0.991 | 1.020 |
| S3 | 0.992 | 1.020 | 0.990 |
protein domains:
|
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|
CL47 ----> CL57
No. of shared pairs: :112
CL47 ----> CL122
No. of shared pairs: :19
CL47 ----> CL808
No. of shared pairs: :10